Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUG2

Polk, DNA polymerase kappa, mousemouse

Predictions only

Length 852 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PolkQ9QUG2 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PolkQ9QUG2 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PolkQ9QUG2 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PolkQ9QUG2 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PolkQ9QUG2 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
PolkQ9QUG2 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
PolkQ9QUG2 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
PolkQ9QUG2 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PolkQ9QUG2 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
PolkQ9QUG2 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PolkQ9QUG2 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PolkQ9QUG2 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
PolkQ9QUG2 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
PolkQ9QUG2 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
PolkQ9QUG2 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
PolkQ9QUG2 Gm3508-201ENSMUST00000186012 792 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
PolkQ9QUG2 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
PolkQ9QUG2 C230062I16Rik-204ENSMUST00000208342 643 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
PolkQ9QUG2 Gm18556-201ENSMUST00000219748 1031 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
PolkQ9QUG2 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PolkQ9QUG2 Fam92b-201ENSMUST00000048786 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
PolkQ9QUG2 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
PolkQ9QUG2 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PolkQ9QUG2 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
PolkQ9QUG2 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PolkQ9QUG2 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PolkQ9QUG2 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PolkQ9QUG2 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
PolkQ9QUG2 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PolkQ9QUG2 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
PolkQ9QUG2 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PolkQ9QUG2 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PolkQ9QUG2 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PolkQ9QUG2 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
PolkQ9QUG2 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
PolkQ9QUG2 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PolkQ9QUG2 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PolkQ9QUG2 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PolkQ9QUG2 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
PolkQ9QUG2 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PolkQ9QUG2 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PolkQ9QUG2 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PolkQ9QUG2 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PolkQ9QUG2 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PolkQ9QUG2 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PolkQ9QUG2 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PolkQ9QUG2 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PolkQ9QUG2 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PolkQ9QUG2 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
PolkQ9QUG2 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
PolkQ9QUG2 Gm42791-202ENSMUST00000147473 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
PolkQ9QUG2 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
PolkQ9QUG2 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
PolkQ9QUG2 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
PolkQ9QUG2 Gm9211-201ENSMUST00000182882 975 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
PolkQ9QUG2 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
PolkQ9QUG2 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
PolkQ9QUG2 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
PolkQ9QUG2 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PolkQ9QUG2 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
PolkQ9QUG2 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
PolkQ9QUG2 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PolkQ9QUG2 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PolkQ9QUG2 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PolkQ9QUG2 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PolkQ9QUG2 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
PolkQ9QUG2 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PolkQ9QUG2 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PolkQ9QUG2 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
PolkQ9QUG2 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PolkQ9QUG2 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PolkQ9QUG2 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PolkQ9QUG2 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC13.82□□□□□ -0.2
PolkQ9QUG2 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PolkQ9QUG2 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PolkQ9QUG2 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PolkQ9QUG2 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PolkQ9QUG2 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PolkQ9QUG2 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
PolkQ9QUG2 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PolkQ9QUG2 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PolkQ9QUG2 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
PolkQ9QUG2 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PolkQ9QUG2 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC13.81□□□□□ -0.2
PolkQ9QUG2 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
PolkQ9QUG2 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PolkQ9QUG2 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
PolkQ9QUG2 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PolkQ9QUG2 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PolkQ9QUG2 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PolkQ9QUG2 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
PolkQ9QUG2 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PolkQ9QUG2 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PolkQ9QUG2 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PolkQ9QUG2 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
PolkQ9QUG2 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
PolkQ9QUG2 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PolkQ9QUG2 Gm14091-201ENSMUST00000133534 874 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
PolkQ9QUG2 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
PolkQ9QUG2 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
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