Protein–RNA interactions for Protein: Q9JME9

Vstm2b, V-set and transmembrane domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm2bQ9JME9 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Vstm2bQ9JME9 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Vstm2bQ9JME9 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Vstm2bQ9JME9 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Vstm2bQ9JME9 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Vstm2bQ9JME9 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Vstm2bQ9JME9 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Vstm2bQ9JME9 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Vstm2bQ9JME9 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Vstm2bQ9JME9 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Vstm2bQ9JME9 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Vstm2bQ9JME9 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Vstm2bQ9JME9 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Vstm2bQ9JME9 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Vstm2bQ9JME9 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Vstm2bQ9JME9 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Vstm2bQ9JME9 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Vstm2bQ9JME9 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Vstm2bQ9JME9 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Vstm2bQ9JME9 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Vstm2bQ9JME9 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Vstm2bQ9JME9 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Vstm2bQ9JME9 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Vstm2bQ9JME9 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Vstm2bQ9JME9 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Vstm2bQ9JME9 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Vstm2bQ9JME9 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Vstm2bQ9JME9 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Vstm2bQ9JME9 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Vstm2bQ9JME9 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Vstm2bQ9JME9 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Vstm2bQ9JME9 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Vstm2bQ9JME9 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Vstm2bQ9JME9 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Vstm2bQ9JME9 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Vstm2bQ9JME9 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Vstm2bQ9JME9 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Vstm2bQ9JME9 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Vstm2bQ9JME9 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Vstm2bQ9JME9 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Vstm2bQ9JME9 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Vstm2bQ9JME9 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Vstm2bQ9JME9 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Vstm2bQ9JME9 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Vstm2bQ9JME9 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Vstm2bQ9JME9 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Vstm2bQ9JME9 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Vstm2bQ9JME9 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Vstm2bQ9JME9 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Vstm2bQ9JME9 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Vstm2bQ9JME9 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Vstm2bQ9JME9 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Vstm2bQ9JME9 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Vstm2bQ9JME9 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Vstm2bQ9JME9 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Vstm2bQ9JME9 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Vstm2bQ9JME9 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Vstm2bQ9JME9 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Vstm2bQ9JME9 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Vstm2bQ9JME9 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Vstm2bQ9JME9 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Vstm2bQ9JME9 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Vstm2bQ9JME9 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Vstm2bQ9JME9 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Vstm2bQ9JME9 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Vstm2bQ9JME9 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Vstm2bQ9JME9 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Vstm2bQ9JME9 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Vstm2bQ9JME9 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Vstm2bQ9JME9 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Vstm2bQ9JME9 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Vstm2bQ9JME9 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Vstm2bQ9JME9 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Vstm2bQ9JME9 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Vstm2bQ9JME9 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Vstm2bQ9JME9 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Vstm2bQ9JME9 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Vstm2bQ9JME9 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Vstm2bQ9JME9 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Vstm2bQ9JME9 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Vstm2bQ9JME9 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Vstm2bQ9JME9 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Vstm2bQ9JME9 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Vstm2bQ9JME9 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Vstm2bQ9JME9 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Vstm2bQ9JME9 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Vstm2bQ9JME9 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Vstm2bQ9JME9 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Vstm2bQ9JME9 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Vstm2bQ9JME9 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Vstm2bQ9JME9 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Vstm2bQ9JME9 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Vstm2bQ9JME9 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Vstm2bQ9JME9 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Vstm2bQ9JME9 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Vstm2bQ9JME9 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Vstm2bQ9JME9 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Vstm2bQ9JME9 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Vstm2bQ9JME9 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Vstm2bQ9JME9 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms