Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Col5a3Q9JLI2 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Col5a3Q9JLI2 Zfp68-201ENSMUST00000063262 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Col5a3Q9JLI2 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Col5a3Q9JLI2 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Col5a3Q9JLI2 Akr1b10-202ENSMUST00000115051 1022 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Col5a3Q9JLI2 Gm11949-201ENSMUST00000117640 372 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Col5a3Q9JLI2 Gm1848-201ENSMUST00000120711 789 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Col5a3Q9JLI2 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Col5a3Q9JLI2 Mrpl23-ps1-201ENSMUST00000173086 580 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Col5a3Q9JLI2 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Col5a3Q9JLI2 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Col5a3Q9JLI2 AC122350.1-201ENSMUST00000228135 533 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Col5a3Q9JLI2 Tex35-201ENSMUST00000027884 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Col5a3Q9JLI2 Tbca-201ENSMUST00000046644 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Col5a3Q9JLI2 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Col5a3Q9JLI2 Olfr1047-201ENSMUST00000099901 960 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Col5a3Q9JLI2 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Col5a3Q9JLI2 Hspa14-201ENSMUST00000027961 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Col5a3Q9JLI2 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Col5a3Q9JLI2 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Col5a3Q9JLI2 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Col5a3Q9JLI2 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Col5a3Q9JLI2 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Col5a3Q9JLI2 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Col5a3Q9JLI2 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Col5a3Q9JLI2 Gm26783-201ENSMUST00000181197 2377 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Col5a3Q9JLI2 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC13□□□□□ -0.33
Col5a3Q9JLI2 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Col5a3Q9JLI2 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Col5a3Q9JLI2 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Col5a3Q9JLI2 Slc10a1-203ENSMUST00000218342 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Col5a3Q9JLI2 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Col5a3Q9JLI2 S100a4-201ENSMUST00000001046 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Col5a3Q9JLI2 Gm14193-201ENSMUST00000105067 153 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Col5a3Q9JLI2 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Col5a3Q9JLI2 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Col5a3Q9JLI2 Treml4-202ENSMUST00000125426 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Col5a3Q9JLI2 4631405J19Rik-204ENSMUST00000145926 936 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Col5a3Q9JLI2 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Col5a3Q9JLI2 Gm29155-201ENSMUST00000185910 269 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Col5a3Q9JLI2 Gm42518-201ENSMUST00000196277 938 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Col5a3Q9JLI2 4931419H13Rik-201ENSMUST00000199770 973 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Col5a3Q9JLI2 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Col5a3Q9JLI2 AC134328.1-201ENSMUST00000222693 667 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Col5a3Q9JLI2 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Col5a3Q9JLI2 1700012P22Rik-201ENSMUST00000030323 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Col5a3Q9JLI2 Gm10135-201ENSMUST00000043711 252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Col5a3Q9JLI2 Gm10338-201ENSMUST00000096148 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Col5a3Q9JLI2 Gm8325-201ENSMUST00000099086 453 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Col5a3Q9JLI2 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Col5a3Q9JLI2 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Col5a3Q9JLI2 Zc3h12a-201ENSMUST00000036188 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Col5a3Q9JLI2 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Col5a3Q9JLI2 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Col5a3Q9JLI2 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Col5a3Q9JLI2 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Col5a3Q9JLI2 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Col5a3Q9JLI2 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Col5a3Q9JLI2 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Col5a3Q9JLI2 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Col5a3Q9JLI2 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Col5a3Q9JLI2 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Col5a3Q9JLI2 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Col5a3Q9JLI2 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Col5a3Q9JLI2 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Col5a3Q9JLI2 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Col5a3Q9JLI2 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Col5a3Q9JLI2 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Col5a3Q9JLI2 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Col5a3Q9JLI2 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Col5a3Q9JLI2 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Col5a3Q9JLI2 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Col5a3Q9JLI2 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Col5a3Q9JLI2 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Col5a3Q9JLI2 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Col5a3Q9JLI2 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Col5a3Q9JLI2 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Col5a3Q9JLI2 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Col5a3Q9JLI2 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Col5a3Q9JLI2 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Col5a3Q9JLI2 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Col5a3Q9JLI2 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Col5a3Q9JLI2 Rtn2-202ENSMUST00000108468 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Col5a3Q9JLI2 Yipf6-202ENSMUST00000113811 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Col5a3Q9JLI2 Gm15507-201ENSMUST00000133523 592 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Col5a3Q9JLI2 Gm19166-201ENSMUST00000196041 1063 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Col5a3Q9JLI2 Gm44552-201ENSMUST00000205458 1247 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Col5a3Q9JLI2 Gm8342-201ENSMUST00000209839 757 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Col5a3Q9JLI2 Scg5-201ENSMUST00000024005 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Col5a3Q9JLI2 Gbgt1-201ENSMUST00000028172 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Col5a3Q9JLI2 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Col5a3Q9JLI2 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms