Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL56

Gde1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gde1Q9JL56 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gde1Q9JL56 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gde1Q9JL56 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gde1Q9JL56 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gde1Q9JL56 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gde1Q9JL56 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gde1Q9JL56 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gde1Q9JL56 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gde1Q9JL56 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gde1Q9JL56 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gde1Q9JL56 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gde1Q9JL56 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gde1Q9JL56 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gde1Q9JL56 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Gde1Q9JL56 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gde1Q9JL56 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gde1Q9JL56 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gde1Q9JL56 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gde1Q9JL56 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gde1Q9JL56 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gde1Q9JL56 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gde1Q9JL56 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gde1Q9JL56 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gde1Q9JL56 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gde1Q9JL56 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gde1Q9JL56 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gde1Q9JL56 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gde1Q9JL56 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gde1Q9JL56 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gde1Q9JL56 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gde1Q9JL56 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gde1Q9JL56 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gde1Q9JL56 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gde1Q9JL56 Gm13408-201ENSMUST00000119822 798 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Gde1Q9JL56 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Gde1Q9JL56 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gde1Q9JL56 Gm12714-201ENSMUST00000143391 669 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gde1Q9JL56 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gde1Q9JL56 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Gde1Q9JL56 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Gde1Q9JL56 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Gde1Q9JL56 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gde1Q9JL56 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gde1Q9JL56 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gde1Q9JL56 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gde1Q9JL56 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gde1Q9JL56 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gde1Q9JL56 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gde1Q9JL56 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gde1Q9JL56 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gde1Q9JL56 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gde1Q9JL56 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Gde1Q9JL56 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gde1Q9JL56 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gde1Q9JL56 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gde1Q9JL56 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gde1Q9JL56 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gde1Q9JL56 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gde1Q9JL56 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gde1Q9JL56 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gde1Q9JL56 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gde1Q9JL56 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gde1Q9JL56 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gde1Q9JL56 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gde1Q9JL56 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Gde1Q9JL56 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gde1Q9JL56 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gde1Q9JL56 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gde1Q9JL56 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gde1Q9JL56 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gde1Q9JL56 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Gde1Q9JL56 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Gde1Q9JL56 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gde1Q9JL56 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gde1Q9JL56 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gde1Q9JL56 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gde1Q9JL56 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gde1Q9JL56 Gm7467-201ENSMUST00000185173 652 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Gde1Q9JL56 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Gde1Q9JL56 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Gde1Q9JL56 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gde1Q9JL56 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gde1Q9JL56 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gde1Q9JL56 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gde1Q9JL56 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gde1Q9JL56 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gde1Q9JL56 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gde1Q9JL56 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gde1Q9JL56 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gde1Q9JL56 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gde1Q9JL56 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gde1Q9JL56 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gde1Q9JL56 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gde1Q9JL56 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gde1Q9JL56 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gde1Q9JL56 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Gde1Q9JL56 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gde1Q9JL56 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gde1Q9JL56 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gde1Q9JL56 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73 ms