Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKP8

Chrac1, Chromatin accessibility complex protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrac1Q9JKP8 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Chrac1Q9JKP8 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Chrac1Q9JKP8 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Chrac1Q9JKP8 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Chrac1Q9JKP8 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Chrac1Q9JKP8 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Chrac1Q9JKP8 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Chrac1Q9JKP8 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Chrac1Q9JKP8 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Chrac1Q9JKP8 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Chrac1Q9JKP8 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Chrac1Q9JKP8 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Chrac1Q9JKP8 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Chrac1Q9JKP8 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Chrac1Q9JKP8 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Chrac1Q9JKP8 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Chrac1Q9JKP8 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Chrac1Q9JKP8 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Chrac1Q9JKP8 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Chrac1Q9JKP8 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Chrac1Q9JKP8 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Chrac1Q9JKP8 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Chrac1Q9JKP8 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Chrac1Q9JKP8 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Chrac1Q9JKP8 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Chrac1Q9JKP8 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
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Chrac1Q9JKP8 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Chrac1Q9JKP8 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Chrac1Q9JKP8 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Chrac1Q9JKP8 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Chrac1Q9JKP8 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Chrac1Q9JKP8 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Chrac1Q9JKP8 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Chrac1Q9JKP8 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Chrac1Q9JKP8 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Chrac1Q9JKP8 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Chrac1Q9JKP8 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Chrac1Q9JKP8 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Chrac1Q9JKP8 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Chrac1Q9JKP8 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Chrac1Q9JKP8 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
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Chrac1Q9JKP8 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Chrac1Q9JKP8 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Chrac1Q9JKP8 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Chrac1Q9JKP8 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
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Chrac1Q9JKP8 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Chrac1Q9JKP8 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
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Chrac1Q9JKP8 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Chrac1Q9JKP8 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
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Chrac1Q9JKP8 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Chrac1Q9JKP8 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Chrac1Q9JKP8 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Chrac1Q9JKP8 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Chrac1Q9JKP8 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Chrac1Q9JKP8 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
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Chrac1Q9JKP8 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
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Chrac1Q9JKP8 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Chrac1Q9JKP8 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Chrac1Q9JKP8 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Chrac1Q9JKP8 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Chrac1Q9JKP8 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Chrac1Q9JKP8 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Chrac1Q9JKP8 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Chrac1Q9JKP8 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Chrac1Q9JKP8 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Chrac1Q9JKP8 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Chrac1Q9JKP8 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Chrac1Q9JKP8 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Chrac1Q9JKP8 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Chrac1Q9JKP8 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Chrac1Q9JKP8 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Chrac1Q9JKP8 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Chrac1Q9JKP8 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Chrac1Q9JKP8 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Chrac1Q9JKP8 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Chrac1Q9JKP8 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Chrac1Q9JKP8 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Chrac1Q9JKP8 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Chrac1Q9JKP8 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Chrac1Q9JKP8 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Chrac1Q9JKP8 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
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