Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKF7

Mrpl39, 39S ribosomal protein L39, mitochondrial, mousemouse

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Length 336 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl39Q9JKF7 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
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Mrpl39Q9JKF7 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Mrpl39Q9JKF7 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Mrpl39Q9JKF7 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Mrpl39Q9JKF7 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Mrpl39Q9JKF7 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Mrpl39Q9JKF7 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Mrpl39Q9JKF7 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Mrpl39Q9JKF7 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Mrpl39Q9JKF7 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Mrpl39Q9JKF7 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Mrpl39Q9JKF7 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Mrpl39Q9JKF7 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Mrpl39Q9JKF7 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Mrpl39Q9JKF7 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Mrpl39Q9JKF7 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Mrpl39Q9JKF7 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Mrpl39Q9JKF7 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Mrpl39Q9JKF7 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Mrpl39Q9JKF7 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Mrpl39Q9JKF7 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Mrpl39Q9JKF7 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Mrpl39Q9JKF7 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Mrpl39Q9JKF7 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Mrpl39Q9JKF7 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Mrpl39Q9JKF7 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Mrpl39Q9JKF7 Tbc1d14-210ENSMUST00000140607 4649 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Mrpl39Q9JKF7 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Mrpl39Q9JKF7 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Mrpl39Q9JKF7 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Mrpl39Q9JKF7 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Mrpl39Q9JKF7 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Mrpl39Q9JKF7 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Mrpl39Q9JKF7 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Mrpl39Q9JKF7 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Mrpl39Q9JKF7 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Mrpl39Q9JKF7 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
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Mrpl39Q9JKF7 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Mrpl39Q9JKF7 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Mrpl39Q9JKF7 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Mrpl39Q9JKF7 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
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Mrpl39Q9JKF7 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Mrpl39Q9JKF7 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
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Mrpl39Q9JKF7 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
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Mrpl39Q9JKF7 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
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Mrpl39Q9JKF7 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
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Mrpl39Q9JKF7 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
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Mrpl39Q9JKF7 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
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Mrpl39Q9JKF7 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Mrpl39Q9JKF7 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Mrpl39Q9JKF7 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Mrpl39Q9JKF7 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
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Mrpl39Q9JKF7 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Mrpl39Q9JKF7 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Mrpl39Q9JKF7 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
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Mrpl39Q9JKF7 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Mrpl39Q9JKF7 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Mrpl39Q9JKF7 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Mrpl39Q9JKF7 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Mrpl39Q9JKF7 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Mrpl39Q9JKF7 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Mrpl39Q9JKF7 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Mrpl39Q9JKF7 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Mrpl39Q9JKF7 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Mrpl39Q9JKF7 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Mrpl39Q9JKF7 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Mrpl39Q9JKF7 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Mrpl39Q9JKF7 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Mrpl39Q9JKF7 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Mrpl39Q9JKF7 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
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