Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES34

Ube3b, Ubiquitin-protein ligase E3B, mousemouse

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Length 1,070 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Ube3bQ9ES34 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Ube3bQ9ES34 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ube3bQ9ES34 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ube3bQ9ES34 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ube3bQ9ES34 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Ube3bQ9ES34 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ube3bQ9ES34 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ube3bQ9ES34 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ube3bQ9ES34 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ube3bQ9ES34 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ube3bQ9ES34 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Ube3bQ9ES34 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms