Protein–RNA interactions for Protein: Q9EP53

Tsc1, Hamartin, mousemouse

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Length 1,161 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsc1Q9EP53 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tsc1Q9EP53 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tsc1Q9EP53 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tsc1Q9EP53 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tsc1Q9EP53 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tsc1Q9EP53 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tsc1Q9EP53 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tsc1Q9EP53 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tsc1Q9EP53 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tsc1Q9EP53 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Tsc1Q9EP53 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tsc1Q9EP53 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tsc1Q9EP53 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tsc1Q9EP53 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Tsc1Q9EP53 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tsc1Q9EP53 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tsc1Q9EP53 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Tsc1Q9EP53 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Tsc1Q9EP53 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tsc1Q9EP53 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tsc1Q9EP53 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tsc1Q9EP53 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tsc1Q9EP53 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Tsc1Q9EP53 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tsc1Q9EP53 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Tsc1Q9EP53 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Tsc1Q9EP53 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tsc1Q9EP53 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tsc1Q9EP53 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tsc1Q9EP53 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tsc1Q9EP53 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tsc1Q9EP53 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tsc1Q9EP53 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tsc1Q9EP53 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tsc1Q9EP53 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Tsc1Q9EP53 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tsc1Q9EP53 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tsc1Q9EP53 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tsc1Q9EP53 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tsc1Q9EP53 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tsc1Q9EP53 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tsc1Q9EP53 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tsc1Q9EP53 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tsc1Q9EP53 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Tsc1Q9EP53 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tsc1Q9EP53 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tsc1Q9EP53 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tsc1Q9EP53 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tsc1Q9EP53 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tsc1Q9EP53 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tsc1Q9EP53 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tsc1Q9EP53 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tsc1Q9EP53 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tsc1Q9EP53 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tsc1Q9EP53 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Tsc1Q9EP53 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Tsc1Q9EP53 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tsc1Q9EP53 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Tsc1Q9EP53 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Tsc1Q9EP53 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tsc1Q9EP53 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tsc1Q9EP53 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tsc1Q9EP53 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tsc1Q9EP53 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tsc1Q9EP53 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tsc1Q9EP53 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tsc1Q9EP53 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tsc1Q9EP53 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tsc1Q9EP53 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tsc1Q9EP53 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tsc1Q9EP53 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tsc1Q9EP53 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tsc1Q9EP53 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tsc1Q9EP53 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tsc1Q9EP53 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tsc1Q9EP53 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tsc1Q9EP53 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tsc1Q9EP53 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tsc1Q9EP53 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Tsc1Q9EP53 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tsc1Q9EP53 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tsc1Q9EP53 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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