Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU3

Riok3, Serine/threonine-protein kinase RIO3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 519 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riok3Q9DBU3 Gm28688-201ENSMUST00000187301 268 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Riok3Q9DBU3 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Riok3Q9DBU3 Ighv5-21-201ENSMUST00000191935 295 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Riok3Q9DBU3 Gm7343-201ENSMUST00000194510 1061 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Riok3Q9DBU3 Gm38562-201ENSMUST00000199398 1126 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Riok3Q9DBU3 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Riok3Q9DBU3 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Riok3Q9DBU3 4930486F22Rik-201ENSMUST00000218077 559 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Riok3Q9DBU3 AC163621.2-201ENSMUST00000222229 682 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Riok3Q9DBU3 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Riok3Q9DBU3 AC102815.1-201ENSMUST00000226662 1061 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Riok3Q9DBU3 AC132863.1-201ENSMUST00000228413 751 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Riok3Q9DBU3 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Riok3Q9DBU3 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Riok3Q9DBU3 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Riok3Q9DBU3 Olfr307-201ENSMUST00000069279 1012 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Riok3Q9DBU3 Olfr799-201ENSMUST00000071126 936 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Riok3Q9DBU3 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Riok3Q9DBU3 Vmn1r125-201ENSMUST00000098739 924 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Riok3Q9DBU3 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Riok3Q9DBU3 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Riok3Q9DBU3 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Riok3Q9DBU3 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Riok3Q9DBU3 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Riok3Q9DBU3 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Riok3Q9DBU3 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Riok3Q9DBU3 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Riok3Q9DBU3 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Riok3Q9DBU3 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Riok3Q9DBU3 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Riok3Q9DBU3 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Riok3Q9DBU3 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Riok3Q9DBU3 Ndufa9-203ENSMUST00000205002 1445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Riok3Q9DBU3 Apobec1-201ENSMUST00000112585 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Riok3Q9DBU3 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Riok3Q9DBU3 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Riok3Q9DBU3 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Riok3Q9DBU3 BC051077-201ENSMUST00000181440 2044 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Riok3Q9DBU3 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Riok3Q9DBU3 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Riok3Q9DBU3 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Riok3Q9DBU3 Gm7869-201ENSMUST00000121457 1322 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Riok3Q9DBU3 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Riok3Q9DBU3 Gm32036-201ENSMUST00000221484 2638 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Riok3Q9DBU3 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Riok3Q9DBU3 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Riok3Q9DBU3 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Riok3Q9DBU3 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Riok3Q9DBU3 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Riok3Q9DBU3 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Riok3Q9DBU3 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Riok3Q9DBU3 Sel1l2-201ENSMUST00000120133 579 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Riok3Q9DBU3 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Riok3Q9DBU3 4921508D12Rik-201ENSMUST00000124095 1075 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Riok3Q9DBU3 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Riok3Q9DBU3 Gm14410-202ENSMUST00000133301 1113 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Riok3Q9DBU3 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Riok3Q9DBU3 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Riok3Q9DBU3 Gm26800-201ENSMUST00000180871 349 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Riok3Q9DBU3 1110020A21Rik-201ENSMUST00000181147 853 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Riok3Q9DBU3 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Riok3Q9DBU3 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Riok3Q9DBU3 Gm38061-201ENSMUST00000192490 365 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Riok3Q9DBU3 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Riok3Q9DBU3 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Riok3Q9DBU3 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Riok3Q9DBU3 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Riok3Q9DBU3 AC192334.3-201ENSMUST00000221828 569 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Riok3Q9DBU3 CT009600.2-201ENSMUST00000226638 481 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Riok3Q9DBU3 Olfr1135-201ENSMUST00000099853 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Riok3Q9DBU3 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Riok3Q9DBU3 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Riok3Q9DBU3 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Riok3Q9DBU3 Olfr700-202ENSMUST00000214840 1505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Riok3Q9DBU3 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Riok3Q9DBU3 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Riok3Q9DBU3 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Riok3Q9DBU3 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Riok3Q9DBU3 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Riok3Q9DBU3 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Riok3Q9DBU3 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Riok3Q9DBU3 Gm6300-201ENSMUST00000192393 1498 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Riok3Q9DBU3 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Riok3Q9DBU3 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Riok3Q9DBU3 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Riok3Q9DBU3 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Riok3Q9DBU3 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Riok3Q9DBU3 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Riok3Q9DBU3 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Riok3Q9DBU3 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Riok3Q9DBU3 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Riok3Q9DBU3 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Riok3Q9DBU3 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Riok3Q9DBU3 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Riok3Q9DBU3 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Riok3Q9DBU3 Rad51b-202ENSMUST00000171210 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Riok3Q9DBU3 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Riok3Q9DBU3 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Riok3Q9DBU3 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Riok3Q9DBU3 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms