Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB40

Med27, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 27, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med27Q9DB40 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Med27Q9DB40 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC11.9□□□□□ -0.51
Med27Q9DB40 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Med27Q9DB40 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Med27Q9DB40 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Med27Q9DB40 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Med27Q9DB40 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Med27Q9DB40 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Med27Q9DB40 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Med27Q9DB40 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Med27Q9DB40 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Med27Q9DB40 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Med27Q9DB40 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Med27Q9DB40 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Med27Q9DB40 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Med27Q9DB40 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Med27Q9DB40 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Med27Q9DB40 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Med27Q9DB40 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Med27Q9DB40 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Med27Q9DB40 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Med27Q9DB40 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Med27Q9DB40 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Med27Q9DB40 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Med27Q9DB40 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Med27Q9DB40 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Med27Q9DB40 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Med27Q9DB40 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Med27Q9DB40 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Med27Q9DB40 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Med27Q9DB40 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Med27Q9DB40 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Med27Q9DB40 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Med27Q9DB40 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Med27Q9DB40 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Med27Q9DB40 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Med27Q9DB40 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Med27Q9DB40 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Med27Q9DB40 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Med27Q9DB40 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Med27Q9DB40 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Med27Q9DB40 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Med27Q9DB40 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Med27Q9DB40 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Med27Q9DB40 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Med27Q9DB40 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Med27Q9DB40 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Med27Q9DB40 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Med27Q9DB40 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Med27Q9DB40 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Med27Q9DB40 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Med27Q9DB40 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Med27Q9DB40 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Med27Q9DB40 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Med27Q9DB40 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Med27Q9DB40 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Med27Q9DB40 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Med27Q9DB40 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Med27Q9DB40 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Med27Q9DB40 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Med27Q9DB40 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Med27Q9DB40 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Med27Q9DB40 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Med27Q9DB40 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Med27Q9DB40 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Med27Q9DB40 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Med27Q9DB40 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Med27Q9DB40 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Med27Q9DB40 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Med27Q9DB40 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Med27Q9DB40 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Med27Q9DB40 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Med27Q9DB40 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Med27Q9DB40 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Med27Q9DB40 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Med27Q9DB40 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Med27Q9DB40 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Med27Q9DB40 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Med27Q9DB40 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Med27Q9DB40 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Med27Q9DB40 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Med27Q9DB40 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Med27Q9DB40 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Med27Q9DB40 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Med27Q9DB40 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Med27Q9DB40 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Med27Q9DB40 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Med27Q9DB40 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Med27Q9DB40 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Med27Q9DB40 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Med27Q9DB40 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Med27Q9DB40 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Med27Q9DB40 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Med27Q9DB40 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Med27Q9DB40 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Med27Q9DB40 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Med27Q9DB40 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Med27Q9DB40 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Med27Q9DB40 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Med27Q9DB40 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms