Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9N2

Cldn34b2, Claudin 34B2, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34b2Q9D9N2 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cldn34b2Q9D9N2 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cldn34b2Q9D9N2 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cldn34b2Q9D9N2 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cldn34b2Q9D9N2 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cldn34b2Q9D9N2 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cldn34b2Q9D9N2 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cldn34b2Q9D9N2 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cldn34b2Q9D9N2 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cldn34b2Q9D9N2 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cldn34b2Q9D9N2 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cldn34b2Q9D9N2 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cldn34b2Q9D9N2 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cldn34b2Q9D9N2 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cldn34b2Q9D9N2 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cldn34b2Q9D9N2 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cldn34b2Q9D9N2 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cldn34b2Q9D9N2 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cldn34b2Q9D9N2 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cldn34b2Q9D9N2 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cldn34b2Q9D9N2 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Cldn34b2Q9D9N2 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cldn34b2Q9D9N2 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cldn34b2Q9D9N2 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Cldn34b2Q9D9N2 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Cldn34b2Q9D9N2 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Cldn34b2Q9D9N2 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Cldn34b2Q9D9N2 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Cldn34b2Q9D9N2 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cldn34b2Q9D9N2 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Cldn34b2Q9D9N2 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cldn34b2Q9D9N2 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cldn34b2Q9D9N2 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cldn34b2Q9D9N2 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cldn34b2Q9D9N2 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cldn34b2Q9D9N2 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cldn34b2Q9D9N2 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cldn34b2Q9D9N2 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cldn34b2Q9D9N2 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cldn34b2Q9D9N2 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cldn34b2Q9D9N2 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cldn34b2Q9D9N2 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cldn34b2Q9D9N2 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cldn34b2Q9D9N2 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cldn34b2Q9D9N2 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cldn34b2Q9D9N2 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cldn34b2Q9D9N2 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cldn34b2Q9D9N2 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cldn34b2Q9D9N2 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Cldn34b2Q9D9N2 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cldn34b2Q9D9N2 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cldn34b2Q9D9N2 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cldn34b2Q9D9N2 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cldn34b2Q9D9N2 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cldn34b2Q9D9N2 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cldn34b2Q9D9N2 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cldn34b2Q9D9N2 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cldn34b2Q9D9N2 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Cldn34b2Q9D9N2 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cldn34b2Q9D9N2 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Cldn34b2Q9D9N2 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Cldn34b2Q9D9N2 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cldn34b2Q9D9N2 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cldn34b2Q9D9N2 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cldn34b2Q9D9N2 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cldn34b2Q9D9N2 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cldn34b2Q9D9N2 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cldn34b2Q9D9N2 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cldn34b2Q9D9N2 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cldn34b2Q9D9N2 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cldn34b2Q9D9N2 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cldn34b2Q9D9N2 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Cldn34b2Q9D9N2 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cldn34b2Q9D9N2 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cldn34b2Q9D9N2 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cldn34b2Q9D9N2 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cldn34b2Q9D9N2 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cldn34b2Q9D9N2 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cldn34b2Q9D9N2 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cldn34b2Q9D9N2 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cldn34b2Q9D9N2 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cldn34b2Q9D9N2 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cldn34b2Q9D9N2 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cldn34b2Q9D9N2 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cldn34b2Q9D9N2 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cldn34b2Q9D9N2 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cldn34b2Q9D9N2 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cldn34b2Q9D9N2 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Cldn34b2Q9D9N2 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Cldn34b2Q9D9N2 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Cldn34b2Q9D9N2 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Cldn34b2Q9D9N2 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Cldn34b2Q9D9N2 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Cldn34b2Q9D9N2 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Cldn34b2Q9D9N2 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Cldn34b2Q9D9N2 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Cldn34b2Q9D9N2 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Cldn34b2Q9D9N2 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Cldn34b2Q9D9N2 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Cldn34b2Q9D9N2 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms