Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8X5

Cnot8, CCR4-NOT transcription complex subunit 8, mousemouse

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Length 292 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot8Q9D8X5 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cnot8Q9D8X5 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cnot8Q9D8X5 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cnot8Q9D8X5 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cnot8Q9D8X5 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cnot8Q9D8X5 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cnot8Q9D8X5 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cnot8Q9D8X5 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cnot8Q9D8X5 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cnot8Q9D8X5 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cnot8Q9D8X5 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cnot8Q9D8X5 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cnot8Q9D8X5 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cnot8Q9D8X5 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Cnot8Q9D8X5 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cnot8Q9D8X5 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Cnot8Q9D8X5 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cnot8Q9D8X5 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cnot8Q9D8X5 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cnot8Q9D8X5 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cnot8Q9D8X5 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cnot8Q9D8X5 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cnot8Q9D8X5 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cnot8Q9D8X5 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cnot8Q9D8X5 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cnot8Q9D8X5 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cnot8Q9D8X5 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cnot8Q9D8X5 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cnot8Q9D8X5 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cnot8Q9D8X5 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cnot8Q9D8X5 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cnot8Q9D8X5 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cnot8Q9D8X5 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cnot8Q9D8X5 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Cnot8Q9D8X5 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cnot8Q9D8X5 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cnot8Q9D8X5 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cnot8Q9D8X5 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cnot8Q9D8X5 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cnot8Q9D8X5 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Cnot8Q9D8X5 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Cnot8Q9D8X5 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC13.33□□□□□ -0.27
Cnot8Q9D8X5 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Cnot8Q9D8X5 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Cnot8Q9D8X5 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Cnot8Q9D8X5 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cnot8Q9D8X5 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cnot8Q9D8X5 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cnot8Q9D8X5 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cnot8Q9D8X5 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cnot8Q9D8X5 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cnot8Q9D8X5 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cnot8Q9D8X5 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cnot8Q9D8X5 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cnot8Q9D8X5 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cnot8Q9D8X5 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cnot8Q9D8X5 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cnot8Q9D8X5 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cnot8Q9D8X5 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cnot8Q9D8X5 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cnot8Q9D8X5 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Cnot8Q9D8X5 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cnot8Q9D8X5 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cnot8Q9D8X5 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cnot8Q9D8X5 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Cnot8Q9D8X5 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cnot8Q9D8X5 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cnot8Q9D8X5 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cnot8Q9D8X5 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cnot8Q9D8X5 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cnot8Q9D8X5 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cnot8Q9D8X5 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cnot8Q9D8X5 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cnot8Q9D8X5 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cnot8Q9D8X5 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cnot8Q9D8X5 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Cnot8Q9D8X5 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cnot8Q9D8X5 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cnot8Q9D8X5 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cnot8Q9D8X5 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Cnot8Q9D8X5 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cnot8Q9D8X5 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cnot8Q9D8X5 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Cnot8Q9D8X5 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Cnot8Q9D8X5 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cnot8Q9D8X5 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cnot8Q9D8X5 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cnot8Q9D8X5 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Cnot8Q9D8X5 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Cnot8Q9D8X5 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cnot8Q9D8X5 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cnot8Q9D8X5 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cnot8Q9D8X5 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cnot8Q9D8X5 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cnot8Q9D8X5 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cnot8Q9D8X5 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cnot8Q9D8X5 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cnot8Q9D8X5 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cnot8Q9D8X5 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cnot8Q9D8X5 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
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