Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8N6

Lin37, Protein lin-37 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lin37Q9D8N6 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lin37Q9D8N6 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lin37Q9D8N6 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lin37Q9D8N6 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lin37Q9D8N6 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lin37Q9D8N6 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lin37Q9D8N6 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
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Lin37Q9D8N6 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lin37Q9D8N6 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lin37Q9D8N6 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lin37Q9D8N6 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lin37Q9D8N6 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lin37Q9D8N6 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lin37Q9D8N6 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lin37Q9D8N6 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lin37Q9D8N6 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lin37Q9D8N6 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lin37Q9D8N6 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lin37Q9D8N6 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lin37Q9D8N6 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lin37Q9D8N6 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lin37Q9D8N6 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lin37Q9D8N6 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lin37Q9D8N6 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lin37Q9D8N6 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lin37Q9D8N6 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lin37Q9D8N6 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lin37Q9D8N6 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lin37Q9D8N6 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lin37Q9D8N6 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lin37Q9D8N6 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lin37Q9D8N6 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lin37Q9D8N6 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Lin37Q9D8N6 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lin37Q9D8N6 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lin37Q9D8N6 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lin37Q9D8N6 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lin37Q9D8N6 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lin37Q9D8N6 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lin37Q9D8N6 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lin37Q9D8N6 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lin37Q9D8N6 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lin37Q9D8N6 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
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Lin37Q9D8N6 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lin37Q9D8N6 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lin37Q9D8N6 Ptpn4-201ENSMUST00000064091 10874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lin37Q9D8N6 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lin37Q9D8N6 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Lin37Q9D8N6 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lin37Q9D8N6 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lin37Q9D8N6 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lin37Q9D8N6 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lin37Q9D8N6 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lin37Q9D8N6 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lin37Q9D8N6 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lin37Q9D8N6 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lin37Q9D8N6 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lin37Q9D8N6 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lin37Q9D8N6 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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Lin37Q9D8N6 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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Lin37Q9D8N6 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lin37Q9D8N6 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lin37Q9D8N6 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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Lin37Q9D8N6 Numa1-201ENSMUST00000084852 7180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lin37Q9D8N6 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
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Lin37Q9D8N6 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lin37Q9D8N6 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lin37Q9D8N6 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lin37Q9D8N6 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lin37Q9D8N6 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lin37Q9D8N6 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lin37Q9D8N6 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lin37Q9D8N6 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lin37Q9D8N6 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lin37Q9D8N6 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lin37Q9D8N6 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lin37Q9D8N6 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lin37Q9D8N6 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Lin37Q9D8N6 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Lin37Q9D8N6 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lin37Q9D8N6 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lin37Q9D8N6 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lin37Q9D8N6 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Lin37Q9D8N6 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lin37Q9D8N6 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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Lin37Q9D8N6 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lin37Q9D8N6 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lin37Q9D8N6 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lin37Q9D8N6 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lin37Q9D8N6 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 138.4 ms