Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8K3

Derl3, Derlin-3, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Derl3Q9D8K3 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Derl3Q9D8K3 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Derl3Q9D8K3 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Derl3Q9D8K3 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Derl3Q9D8K3 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Derl3Q9D8K3 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Derl3Q9D8K3 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Derl3Q9D8K3 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Derl3Q9D8K3 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Derl3Q9D8K3 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Derl3Q9D8K3 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Derl3Q9D8K3 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Derl3Q9D8K3 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Derl3Q9D8K3 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Derl3Q9D8K3 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Derl3Q9D8K3 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Derl3Q9D8K3 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Derl3Q9D8K3 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Derl3Q9D8K3 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Derl3Q9D8K3 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Derl3Q9D8K3 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Derl3Q9D8K3 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Derl3Q9D8K3 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Derl3Q9D8K3 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Derl3Q9D8K3 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Derl3Q9D8K3 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Derl3Q9D8K3 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Derl3Q9D8K3 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Derl3Q9D8K3 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Derl3Q9D8K3 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Derl3Q9D8K3 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Derl3Q9D8K3 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Derl3Q9D8K3 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Derl3Q9D8K3 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Derl3Q9D8K3 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Derl3Q9D8K3 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Derl3Q9D8K3 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Derl3Q9D8K3 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Derl3Q9D8K3 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Derl3Q9D8K3 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Derl3Q9D8K3 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Derl3Q9D8K3 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Derl3Q9D8K3 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Derl3Q9D8K3 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Derl3Q9D8K3 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Derl3Q9D8K3 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Derl3Q9D8K3 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Derl3Q9D8K3 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Derl3Q9D8K3 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Derl3Q9D8K3 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Derl3Q9D8K3 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Derl3Q9D8K3 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Derl3Q9D8K3 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Derl3Q9D8K3 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Derl3Q9D8K3 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Derl3Q9D8K3 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Derl3Q9D8K3 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Derl3Q9D8K3 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Derl3Q9D8K3 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Derl3Q9D8K3 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Derl3Q9D8K3 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Derl3Q9D8K3 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Derl3Q9D8K3 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Derl3Q9D8K3 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Derl3Q9D8K3 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Derl3Q9D8K3 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Derl3Q9D8K3 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Derl3Q9D8K3 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Derl3Q9D8K3 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Derl3Q9D8K3 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Derl3Q9D8K3 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Derl3Q9D8K3 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Derl3Q9D8K3 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Derl3Q9D8K3 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Derl3Q9D8K3 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Derl3Q9D8K3 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Derl3Q9D8K3 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Derl3Q9D8K3 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Derl3Q9D8K3 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Derl3Q9D8K3 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Derl3Q9D8K3 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Derl3Q9D8K3 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Derl3Q9D8K3 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Derl3Q9D8K3 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Derl3Q9D8K3 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Derl3Q9D8K3 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Derl3Q9D8K3 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Derl3Q9D8K3 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Derl3Q9D8K3 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Derl3Q9D8K3 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Derl3Q9D8K3 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Derl3Q9D8K3 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Derl3Q9D8K3 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Derl3Q9D8K3 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Derl3Q9D8K3 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Derl3Q9D8K3 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Derl3Q9D8K3 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Derl3Q9D8K3 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Derl3Q9D8K3 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Derl3Q9D8K3 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms