Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7F7

Chmp4c, Charged multivesicular body protein 4c, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp4cQ9D7F7 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Chmp4cQ9D7F7 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chmp4cQ9D7F7 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Chmp4cQ9D7F7 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chmp4cQ9D7F7 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chmp4cQ9D7F7 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chmp4cQ9D7F7 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chmp4cQ9D7F7 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chmp4cQ9D7F7 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chmp4cQ9D7F7 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chmp4cQ9D7F7 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chmp4cQ9D7F7 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chmp4cQ9D7F7 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chmp4cQ9D7F7 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Chmp4cQ9D7F7 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chmp4cQ9D7F7 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chmp4cQ9D7F7 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chmp4cQ9D7F7 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chmp4cQ9D7F7 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chmp4cQ9D7F7 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Chmp4cQ9D7F7 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chmp4cQ9D7F7 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chmp4cQ9D7F7 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chmp4cQ9D7F7 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chmp4cQ9D7F7 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chmp4cQ9D7F7 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chmp4cQ9D7F7 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chmp4cQ9D7F7 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chmp4cQ9D7F7 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chmp4cQ9D7F7 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chmp4cQ9D7F7 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chmp4cQ9D7F7 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chmp4cQ9D7F7 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chmp4cQ9D7F7 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chmp4cQ9D7F7 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chmp4cQ9D7F7 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Chmp4cQ9D7F7 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chmp4cQ9D7F7 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chmp4cQ9D7F7 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chmp4cQ9D7F7 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Chmp4cQ9D7F7 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Chmp4cQ9D7F7 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chmp4cQ9D7F7 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chmp4cQ9D7F7 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chmp4cQ9D7F7 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chmp4cQ9D7F7 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chmp4cQ9D7F7 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chmp4cQ9D7F7 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chmp4cQ9D7F7 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chmp4cQ9D7F7 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chmp4cQ9D7F7 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chmp4cQ9D7F7 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chmp4cQ9D7F7 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chmp4cQ9D7F7 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chmp4cQ9D7F7 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chmp4cQ9D7F7 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chmp4cQ9D7F7 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Chmp4cQ9D7F7 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chmp4cQ9D7F7 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chmp4cQ9D7F7 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chmp4cQ9D7F7 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Chmp4cQ9D7F7 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Chmp4cQ9D7F7 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Chmp4cQ9D7F7 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Chmp4cQ9D7F7 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Chmp4cQ9D7F7 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Chmp4cQ9D7F7 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Chmp4cQ9D7F7 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Chmp4cQ9D7F7 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Chmp4cQ9D7F7 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Chmp4cQ9D7F7 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Chmp4cQ9D7F7 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Chmp4cQ9D7F7 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Chmp4cQ9D7F7 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Chmp4cQ9D7F7 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Chmp4cQ9D7F7 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Chmp4cQ9D7F7 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Chmp4cQ9D7F7 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Chmp4cQ9D7F7 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Chmp4cQ9D7F7 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Chmp4cQ9D7F7 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Chmp4cQ9D7F7 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Chmp4cQ9D7F7 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Chmp4cQ9D7F7 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Chmp4cQ9D7F7 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Chmp4cQ9D7F7 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Chmp4cQ9D7F7 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Chmp4cQ9D7F7 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Chmp4cQ9D7F7 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Chmp4cQ9D7F7 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Chmp4cQ9D7F7 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Chmp4cQ9D7F7 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Chmp4cQ9D7F7 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Chmp4cQ9D7F7 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Chmp4cQ9D7F7 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Chmp4cQ9D7F7 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Chmp4cQ9D7F7 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Chmp4cQ9D7F7 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Chmp4cQ9D7F7 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Chmp4cQ9D7F7 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms