Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7D7

Cldn23, Claudin-23, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn23Q9D7D7 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn23Q9D7D7 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn23Q9D7D7 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn23Q9D7D7 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn23Q9D7D7 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn23Q9D7D7 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn23Q9D7D7 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn23Q9D7D7 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn23Q9D7D7 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn23Q9D7D7 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn23Q9D7D7 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn23Q9D7D7 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn23Q9D7D7 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn23Q9D7D7 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn23Q9D7D7 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn23Q9D7D7 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn23Q9D7D7 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn23Q9D7D7 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn23Q9D7D7 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn23Q9D7D7 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn23Q9D7D7 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn23Q9D7D7 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn23Q9D7D7 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn23Q9D7D7 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn23Q9D7D7 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn23Q9D7D7 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn23Q9D7D7 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn23Q9D7D7 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn23Q9D7D7 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn23Q9D7D7 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn23Q9D7D7 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn23Q9D7D7 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn23Q9D7D7 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn23Q9D7D7 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn23Q9D7D7 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn23Q9D7D7 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn23Q9D7D7 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn23Q9D7D7 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn23Q9D7D7 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn23Q9D7D7 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn23Q9D7D7 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn23Q9D7D7 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn23Q9D7D7 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn23Q9D7D7 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn23Q9D7D7 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn23Q9D7D7 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn23Q9D7D7 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn23Q9D7D7 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn23Q9D7D7 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn23Q9D7D7 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn23Q9D7D7 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn23Q9D7D7 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn23Q9D7D7 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn23Q9D7D7 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn23Q9D7D7 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn23Q9D7D7 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn23Q9D7D7 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn23Q9D7D7 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn23Q9D7D7 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn23Q9D7D7 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn23Q9D7D7 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn23Q9D7D7 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn23Q9D7D7 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn23Q9D7D7 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn23Q9D7D7 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn23Q9D7D7 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn23Q9D7D7 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn23Q9D7D7 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cldn23Q9D7D7 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn23Q9D7D7 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn23Q9D7D7 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn23Q9D7D7 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn23Q9D7D7 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn23Q9D7D7 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn23Q9D7D7 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn23Q9D7D7 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn23Q9D7D7 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn23Q9D7D7 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn23Q9D7D7 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn23Q9D7D7 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn23Q9D7D7 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn23Q9D7D7 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn23Q9D7D7 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn23Q9D7D7 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn23Q9D7D7 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn23Q9D7D7 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn23Q9D7D7 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn23Q9D7D7 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn23Q9D7D7 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn23Q9D7D7 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn23Q9D7D7 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn23Q9D7D7 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn23Q9D7D7 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn23Q9D7D7 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn23Q9D7D7 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn23Q9D7D7 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn23Q9D7D7 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn23Q9D7D7 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn23Q9D7D7 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn23Q9D7D7 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms