Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Z1

Nop56, Nucleolar protein 56, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop56Q9D6Z1 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nop56Q9D6Z1 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nop56Q9D6Z1 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nop56Q9D6Z1 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Nop56Q9D6Z1 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nop56Q9D6Z1 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nop56Q9D6Z1 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Nop56Q9D6Z1 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nop56Q9D6Z1 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nop56Q9D6Z1 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nop56Q9D6Z1 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nop56Q9D6Z1 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nop56Q9D6Z1 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nop56Q9D6Z1 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nop56Q9D6Z1 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nop56Q9D6Z1 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nop56Q9D6Z1 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nop56Q9D6Z1 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nop56Q9D6Z1 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nop56Q9D6Z1 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nop56Q9D6Z1 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nop56Q9D6Z1 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nop56Q9D6Z1 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Nop56Q9D6Z1 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nop56Q9D6Z1 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nop56Q9D6Z1 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nop56Q9D6Z1 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nop56Q9D6Z1 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nop56Q9D6Z1 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nop56Q9D6Z1 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nop56Q9D6Z1 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nop56Q9D6Z1 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nop56Q9D6Z1 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nop56Q9D6Z1 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nop56Q9D6Z1 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nop56Q9D6Z1 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nop56Q9D6Z1 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nop56Q9D6Z1 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nop56Q9D6Z1 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nop56Q9D6Z1 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Nop56Q9D6Z1 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nop56Q9D6Z1 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Nop56Q9D6Z1 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nop56Q9D6Z1 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nop56Q9D6Z1 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nop56Q9D6Z1 Gm32390-201ENSMUST00000212713 1172 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Nop56Q9D6Z1 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nop56Q9D6Z1 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nop56Q9D6Z1 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nop56Q9D6Z1 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nop56Q9D6Z1 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nop56Q9D6Z1 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nop56Q9D6Z1 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nop56Q9D6Z1 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nop56Q9D6Z1 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nop56Q9D6Z1 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nop56Q9D6Z1 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nop56Q9D6Z1 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nop56Q9D6Z1 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nop56Q9D6Z1 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nop56Q9D6Z1 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nop56Q9D6Z1 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nop56Q9D6Z1 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nop56Q9D6Z1 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nop56Q9D6Z1 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nop56Q9D6Z1 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nop56Q9D6Z1 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nop56Q9D6Z1 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nop56Q9D6Z1 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nop56Q9D6Z1 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nop56Q9D6Z1 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nop56Q9D6Z1 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nop56Q9D6Z1 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nop56Q9D6Z1 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nop56Q9D6Z1 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nop56Q9D6Z1 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nop56Q9D6Z1 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Nop56Q9D6Z1 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nop56Q9D6Z1 Gm16178-201ENSMUST00000129408 677 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nop56Q9D6Z1 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nop56Q9D6Z1 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nop56Q9D6Z1 Gm37102-201ENSMUST00000195740 1105 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Nop56Q9D6Z1 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nop56Q9D6Z1 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nop56Q9D6Z1 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Nop56Q9D6Z1 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Nop56Q9D6Z1 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nop56Q9D6Z1 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nop56Q9D6Z1 AC123738.2-201ENSMUST00000223791 1899 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Nop56Q9D6Z1 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nop56Q9D6Z1 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nop56Q9D6Z1 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nop56Q9D6Z1 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nop56Q9D6Z1 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nop56Q9D6Z1 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nop56Q9D6Z1 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nop56Q9D6Z1 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nop56Q9D6Z1 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nop56Q9D6Z1 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nop56Q9D6Z1 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms