Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6E4

Ttc9b, Tetratricopeptide repeat protein 9B, mousemouse

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Length 239 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc9bQ9D6E4 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ttc9bQ9D6E4 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ttc9bQ9D6E4 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ttc9bQ9D6E4 Olfr22-ps1-201ENSMUST00000115991 1237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ttc9bQ9D6E4 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Ttc9bQ9D6E4 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ttc9bQ9D6E4 9430091E24Rik-201ENSMUST00000127301 1067 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ttc9bQ9D6E4 2310057J18Rik-204ENSMUST00000152363 1043 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ttc9bQ9D6E4 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ttc9bQ9D6E4 C730034F03Rik-201ENSMUST00000168646 1280 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ttc9bQ9D6E4 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Ttc9bQ9D6E4 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Ttc9bQ9D6E4 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Ttc9bQ9D6E4 Gm45398-201ENSMUST00000210561 165 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Ttc9bQ9D6E4 Gm37419-201ENSMUST00000210705 114 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ttc9bQ9D6E4 Gm6145-204ENSMUST00000210902 1266 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ttc9bQ9D6E4 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ttc9bQ9D6E4 Nop10-201ENSMUST00000028553 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ttc9bQ9D6E4 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Ttc9bQ9D6E4 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ttc9bQ9D6E4 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ttc9bQ9D6E4 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ttc9bQ9D6E4 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ttc9bQ9D6E4 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ttc9bQ9D6E4 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ttc9bQ9D6E4 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
Ttc9bQ9D6E4 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ttc9bQ9D6E4 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ttc9bQ9D6E4 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ttc9bQ9D6E4 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ttc9bQ9D6E4 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ttc9bQ9D6E4 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ttc9bQ9D6E4 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ttc9bQ9D6E4 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ttc9bQ9D6E4 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ttc9bQ9D6E4 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ttc9bQ9D6E4 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ttc9bQ9D6E4 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ttc9bQ9D6E4 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
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Ttc9bQ9D6E4 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ttc9bQ9D6E4 Spx-202ENSMUST00000126521 357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
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Ttc9bQ9D6E4 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ttc9bQ9D6E4 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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Ttc9bQ9D6E4 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ttc9bQ9D6E4 AC171241.1-201ENSMUST00000228144 1166 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Ttc9bQ9D6E4 Emp3-201ENSMUST00000038876 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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Ttc9bQ9D6E4 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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Ttc9bQ9D6E4 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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Ttc9bQ9D6E4 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ttc9bQ9D6E4 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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Ttc9bQ9D6E4 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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Ttc9bQ9D6E4 Scoc-202ENSMUST00000167525 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ttc9bQ9D6E4 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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Ttc9bQ9D6E4 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ttc9bQ9D6E4 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ttc9bQ9D6E4 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ttc9bQ9D6E4 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ttc9bQ9D6E4 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ttc9bQ9D6E4 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ttc9bQ9D6E4 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ttc9bQ9D6E4 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ttc9bQ9D6E4 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ttc9bQ9D6E4 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ttc9bQ9D6E4 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ttc9bQ9D6E4 Prss46-201ENSMUST00000119427 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ttc9bQ9D6E4 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Ttc9bQ9D6E4 Gm7535-201ENSMUST00000164167 909 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ttc9bQ9D6E4 Rn7s6-201ENSMUST00000175005 291 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Ttc9bQ9D6E4 Prss46-202ENSMUST00000176403 1257 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ttc9bQ9D6E4 Insig2-214ENSMUST00000186915 674 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ttc9bQ9D6E4 Gm6905-201ENSMUST00000205729 511 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Ttc9bQ9D6E4 Mrnip-201ENSMUST00000020647 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ttc9bQ9D6E4 Gm45285-201ENSMUST00000210418 749 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ttc9bQ9D6E4 Gm7395-201ENSMUST00000216059 1045 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Ttc9bQ9D6E4 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ttc9bQ9D6E4 Gm34809-203ENSMUST00000222945 509 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ttc9bQ9D6E4 Snora73b-201ENSMUST00000083419 205 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Ttc9bQ9D6E4 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ttc9bQ9D6E4 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms