Protein–RNA interactions for Protein: Q9D541

Ccdc7, Coiled-coil domain-containing protein 7, mousemouse

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Length 371 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc7Q9D541 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc7Q9D541 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc7Q9D541 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc7Q9D541 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc7Q9D541 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc7Q9D541 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc7Q9D541 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc7Q9D541 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc7Q9D541 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc7Q9D541 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc7Q9D541 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc7Q9D541 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc7Q9D541 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc7Q9D541 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc7Q9D541 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc7Q9D541 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc7Q9D541 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc7Q9D541 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc7Q9D541 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc7Q9D541 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc7Q9D541 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc7Q9D541 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc7Q9D541 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc7Q9D541 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc7Q9D541 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc7Q9D541 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc7Q9D541 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc7Q9D541 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc7Q9D541 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc7Q9D541 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc7Q9D541 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc7Q9D541 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc7Q9D541 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc7Q9D541 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc7Q9D541 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc7Q9D541 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc7Q9D541 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Ccdc7Q9D541 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc7Q9D541 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc7Q9D541 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc7Q9D541 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc7Q9D541 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc7Q9D541 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc7Q9D541 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc7Q9D541 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc7Q9D541 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc7Q9D541 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc7Q9D541 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc7Q9D541 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc7Q9D541 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc7Q9D541 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc7Q9D541 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Ccdc7Q9D541 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Ccdc7Q9D541 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc7Q9D541 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc7Q9D541 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc7Q9D541 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc7Q9D541 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc7Q9D541 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Ccdc7Q9D541 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc7Q9D541 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc7Q9D541 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc7Q9D541 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc7Q9D541 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc7Q9D541 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc7Q9D541 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc7Q9D541 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc7Q9D541 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc7Q9D541 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc7Q9D541 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc7Q9D541 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc7Q9D541 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc7Q9D541 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc7Q9D541 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc7Q9D541 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc7Q9D541 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc7Q9D541 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc7Q9D541 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc7Q9D541 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc7Q9D541 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc7Q9D541 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc7Q9D541 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc7Q9D541 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc7Q9D541 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc7Q9D541 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc7Q9D541 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc7Q9D541 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc7Q9D541 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc7Q9D541 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc7Q9D541 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc7Q9D541 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc7Q9D541 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc7Q9D541 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc7Q9D541 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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