Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1E5

Lmbr1l, Protein LMBR1L, mousemouse

Predictions only

Length 489 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbr1lQ9D1E5 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lmbr1lQ9D1E5 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lmbr1lQ9D1E5 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lmbr1lQ9D1E5 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lmbr1lQ9D1E5 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lmbr1lQ9D1E5 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Lmbr1lQ9D1E5 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lmbr1lQ9D1E5 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lmbr1lQ9D1E5 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lmbr1lQ9D1E5 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lmbr1lQ9D1E5 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lmbr1lQ9D1E5 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lmbr1lQ9D1E5 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lmbr1lQ9D1E5 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lmbr1lQ9D1E5 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lmbr1lQ9D1E5 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lmbr1lQ9D1E5 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lmbr1lQ9D1E5 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lmbr1lQ9D1E5 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Lmbr1lQ9D1E5 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lmbr1lQ9D1E5 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lmbr1lQ9D1E5 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lmbr1lQ9D1E5 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lmbr1lQ9D1E5 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lmbr1lQ9D1E5 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lmbr1lQ9D1E5 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lmbr1lQ9D1E5 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lmbr1lQ9D1E5 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lmbr1lQ9D1E5 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lmbr1lQ9D1E5 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lmbr1lQ9D1E5 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lmbr1lQ9D1E5 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lmbr1lQ9D1E5 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lmbr1lQ9D1E5 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lmbr1lQ9D1E5 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lmbr1lQ9D1E5 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lmbr1lQ9D1E5 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lmbr1lQ9D1E5 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lmbr1lQ9D1E5 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lmbr1lQ9D1E5 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lmbr1lQ9D1E5 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lmbr1lQ9D1E5 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lmbr1lQ9D1E5 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lmbr1lQ9D1E5 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lmbr1lQ9D1E5 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lmbr1lQ9D1E5 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lmbr1lQ9D1E5 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lmbr1lQ9D1E5 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Lmbr1lQ9D1E5 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lmbr1lQ9D1E5 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lmbr1lQ9D1E5 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Lmbr1lQ9D1E5 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lmbr1lQ9D1E5 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Lmbr1lQ9D1E5 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lmbr1lQ9D1E5 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lmbr1lQ9D1E5 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lmbr1lQ9D1E5 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lmbr1lQ9D1E5 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lmbr1lQ9D1E5 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lmbr1lQ9D1E5 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lmbr1lQ9D1E5 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lmbr1lQ9D1E5 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Lmbr1lQ9D1E5 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lmbr1lQ9D1E5 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lmbr1lQ9D1E5 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lmbr1lQ9D1E5 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lmbr1lQ9D1E5 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lmbr1lQ9D1E5 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Lmbr1lQ9D1E5 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lmbr1lQ9D1E5 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lmbr1lQ9D1E5 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lmbr1lQ9D1E5 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lmbr1lQ9D1E5 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lmbr1lQ9D1E5 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lmbr1lQ9D1E5 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lmbr1lQ9D1E5 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lmbr1lQ9D1E5 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lmbr1lQ9D1E5 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lmbr1lQ9D1E5 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lmbr1lQ9D1E5 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Lmbr1lQ9D1E5 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lmbr1lQ9D1E5 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lmbr1lQ9D1E5 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lmbr1lQ9D1E5 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Lmbr1lQ9D1E5 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Lmbr1lQ9D1E5 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lmbr1lQ9D1E5 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lmbr1lQ9D1E5 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lmbr1lQ9D1E5 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lmbr1lQ9D1E5 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lmbr1lQ9D1E5 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Lmbr1lQ9D1E5 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lmbr1lQ9D1E5 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lmbr1lQ9D1E5 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lmbr1lQ9D1E5 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lmbr1lQ9D1E5 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lmbr1lQ9D1E5 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lmbr1lQ9D1E5 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Lmbr1lQ9D1E5 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lmbr1lQ9D1E5 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms