Protein–RNA interactions for Protein: Q9D187

Fam96b, Mitotic spindle-associated MMXD complex subunit MIP18, mousemouse

Predictions only

Length 163 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam96bQ9D187 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Fam96bQ9D187 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Fam96bQ9D187 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Fam96bQ9D187 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Fam96bQ9D187 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Fam96bQ9D187 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Fam96bQ9D187 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Fam96bQ9D187 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Fam96bQ9D187 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Fam96bQ9D187 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Fam96bQ9D187 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Fam96bQ9D187 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Fam96bQ9D187 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Fam96bQ9D187 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Fam96bQ9D187 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Fam96bQ9D187 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Fam96bQ9D187 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Fam96bQ9D187 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Fam96bQ9D187 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Fam96bQ9D187 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Fam96bQ9D187 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Fam96bQ9D187 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Fam96bQ9D187 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Fam96bQ9D187 Grip1-205ENSMUST00000105262 4996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Fam96bQ9D187 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Fam96bQ9D187 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Fam96bQ9D187 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Fam96bQ9D187 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Fam96bQ9D187 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Fam96bQ9D187 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Fam96bQ9D187 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Fam96bQ9D187 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Fam96bQ9D187 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Fam96bQ9D187 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Fam96bQ9D187 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Fam96bQ9D187 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Fam96bQ9D187 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Fam96bQ9D187 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Fam96bQ9D187 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Fam96bQ9D187 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Fam96bQ9D187 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Fam96bQ9D187 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Fam96bQ9D187 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Fam96bQ9D187 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Fam96bQ9D187 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Fam96bQ9D187 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Fam96bQ9D187 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Fam96bQ9D187 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Fam96bQ9D187 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Fam96bQ9D187 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Fam96bQ9D187 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Fam96bQ9D187 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Fam96bQ9D187 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Fam96bQ9D187 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Fam96bQ9D187 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Fam96bQ9D187 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Fam96bQ9D187 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Fam96bQ9D187 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Fam96bQ9D187 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Fam96bQ9D187 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Fam96bQ9D187 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Fam96bQ9D187 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Fam96bQ9D187 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Fam96bQ9D187 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Fam96bQ9D187 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Fam96bQ9D187 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Fam96bQ9D187 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Fam96bQ9D187 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Fam96bQ9D187 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Fam96bQ9D187 Knop1-202ENSMUST00000063607 4884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Fam96bQ9D187 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Fam96bQ9D187 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Fam96bQ9D187 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Fam96bQ9D187 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Fam96bQ9D187 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Fam96bQ9D187 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Fam96bQ9D187 Nedd9-202ENSMUST00000163623 4626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Fam96bQ9D187 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Fam96bQ9D187 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Fam96bQ9D187 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Fam96bQ9D187 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Fam96bQ9D187 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Fam96bQ9D187 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Fam96bQ9D187 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Fam96bQ9D187 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Fam96bQ9D187 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Fam96bQ9D187 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Fam96bQ9D187 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Fam96bQ9D187 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Fam96bQ9D187 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Fam96bQ9D187 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Fam96bQ9D187 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Fam96bQ9D187 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Fam96bQ9D187 Rbm47-202ENSMUST00000094757 4643 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Fam96bQ9D187 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Fam96bQ9D187 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Fam96bQ9D187 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Fam96bQ9D187 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Fam96bQ9D187 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Fam96bQ9D187 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms