Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0D5

Gtf2e1, General transcription factor IIE subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2e1Q9D0D5 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gtf2e1Q9D0D5 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Gtf2e1Q9D0D5 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gtf2e1Q9D0D5 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Gtf2e1Q9D0D5 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Gtf2e1Q9D0D5 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gtf2e1Q9D0D5 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gtf2e1Q9D0D5 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gtf2e1Q9D0D5 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gtf2e1Q9D0D5 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gtf2e1Q9D0D5 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gtf2e1Q9D0D5 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gtf2e1Q9D0D5 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gtf2e1Q9D0D5 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gtf2e1Q9D0D5 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gtf2e1Q9D0D5 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gtf2e1Q9D0D5 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gtf2e1Q9D0D5 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gtf2e1Q9D0D5 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gtf2e1Q9D0D5 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gtf2e1Q9D0D5 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gtf2e1Q9D0D5 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gtf2e1Q9D0D5 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Gtf2e1Q9D0D5 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gtf2e1Q9D0D5 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gtf2e1Q9D0D5 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gtf2e1Q9D0D5 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gtf2e1Q9D0D5 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gtf2e1Q9D0D5 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gtf2e1Q9D0D5 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gtf2e1Q9D0D5 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gtf2e1Q9D0D5 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gtf2e1Q9D0D5 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gtf2e1Q9D0D5 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Gtf2e1Q9D0D5 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gtf2e1Q9D0D5 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Gtf2e1Q9D0D5 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Gtf2e1Q9D0D5 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gtf2e1Q9D0D5 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gtf2e1Q9D0D5 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Gtf2e1Q9D0D5 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gtf2e1Q9D0D5 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gtf2e1Q9D0D5 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gtf2e1Q9D0D5 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gtf2e1Q9D0D5 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gtf2e1Q9D0D5 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gtf2e1Q9D0D5 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Gtf2e1Q9D0D5 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gtf2e1Q9D0D5 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gtf2e1Q9D0D5 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gtf2e1Q9D0D5 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gtf2e1Q9D0D5 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gtf2e1Q9D0D5 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gtf2e1Q9D0D5 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gtf2e1Q9D0D5 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gtf2e1Q9D0D5 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gtf2e1Q9D0D5 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gtf2e1Q9D0D5 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gtf2e1Q9D0D5 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gtf2e1Q9D0D5 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gtf2e1Q9D0D5 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gtf2e1Q9D0D5 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gtf2e1Q9D0D5 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gtf2e1Q9D0D5 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gtf2e1Q9D0D5 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gtf2e1Q9D0D5 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gtf2e1Q9D0D5 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gtf2e1Q9D0D5 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Gtf2e1Q9D0D5 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gtf2e1Q9D0D5 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Gtf2e1Q9D0D5 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gtf2e1Q9D0D5 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gtf2e1Q9D0D5 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Gtf2e1Q9D0D5 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gtf2e1Q9D0D5 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Gtf2e1Q9D0D5 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gtf2e1Q9D0D5 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gtf2e1Q9D0D5 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gtf2e1Q9D0D5 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
Gtf2e1Q9D0D5 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gtf2e1Q9D0D5 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
Gtf2e1Q9D0D5 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gtf2e1Q9D0D5 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gtf2e1Q9D0D5 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gtf2e1Q9D0D5 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gtf2e1Q9D0D5 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gtf2e1Q9D0D5 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gtf2e1Q9D0D5 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gtf2e1Q9D0D5 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gtf2e1Q9D0D5 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gtf2e1Q9D0D5 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gtf2e1Q9D0D5 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Gtf2e1Q9D0D5 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gtf2e1Q9D0D5 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gtf2e1Q9D0D5 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gtf2e1Q9D0D5 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gtf2e1Q9D0D5 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gtf2e1Q9D0D5 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gtf2e1Q9D0D5 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gtf2e1Q9D0D5 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms