Protein–RNA interactions for Protein: Q9D071

Mms19, MMS19 nucleotide excision repair protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,031 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mms19Q9D071 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mms19Q9D071 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mms19Q9D071 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mms19Q9D071 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mms19Q9D071 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mms19Q9D071 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Mms19Q9D071 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mms19Q9D071 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mms19Q9D071 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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Mms19Q9D071 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
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Mms19Q9D071 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mms19Q9D071 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mms19Q9D071 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mms19Q9D071 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
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Mms19Q9D071 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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Mms19Q9D071 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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Mms19Q9D071 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mms19Q9D071 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mms19Q9D071 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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Mms19Q9D071 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mms19Q9D071 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mms19Q9D071 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Mms19Q9D071 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Mms19Q9D071 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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Mms19Q9D071 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Mms19Q9D071 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Mms19Q9D071 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Mms19Q9D071 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Mms19Q9D071 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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Mms19Q9D071 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Mms19Q9D071 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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Mms19Q9D071 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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Mms19Q9D071 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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Mms19Q9D071 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Mms19Q9D071 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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Mms19Q9D071 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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Mms19Q9D071 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
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Mms19Q9D071 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Mms19Q9D071 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Mms19Q9D071 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Mms19Q9D071 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Mms19Q9D071 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Mms19Q9D071 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Mms19Q9D071 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Mms19Q9D071 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Mms19Q9D071 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Mms19Q9D071 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Mms19Q9D071 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Mms19Q9D071 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Mms19Q9D071 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Mms19Q9D071 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Mms19Q9D071 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Mms19Q9D071 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Mms19Q9D071 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Mms19Q9D071 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Mms19Q9D071 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
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