Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc47Q9D024 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc47Q9D024 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc47Q9D024 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc47Q9D024 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc47Q9D024 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc47Q9D024 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc47Q9D024 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc47Q9D024 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc47Q9D024 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc47Q9D024 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc47Q9D024 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc47Q9D024 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc47Q9D024 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc47Q9D024 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc47Q9D024 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc47Q9D024 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc47Q9D024 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc47Q9D024 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc47Q9D024 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc47Q9D024 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc47Q9D024 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc47Q9D024 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc47Q9D024 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc47Q9D024 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc47Q9D024 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc47Q9D024 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc47Q9D024 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc47Q9D024 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc47Q9D024 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc47Q9D024 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc47Q9D024 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc47Q9D024 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc47Q9D024 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc47Q9D024 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc47Q9D024 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc47Q9D024 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc47Q9D024 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc47Q9D024 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc47Q9D024 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc47Q9D024 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ccdc47Q9D024 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ccdc47Q9D024 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ccdc47Q9D024 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ccdc47Q9D024 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
Ccdc47Q9D024 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc47Q9D024 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc47Q9D024 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc47Q9D024 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc47Q9D024 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc47Q9D024 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc47Q9D024 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc47Q9D024 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc47Q9D024 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc47Q9D024 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc47Q9D024 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc47Q9D024 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc47Q9D024 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc47Q9D024 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc47Q9D024 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc47Q9D024 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc47Q9D024 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc47Q9D024 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc47Q9D024 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc47Q9D024 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc47Q9D024 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc47Q9D024 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc47Q9D024 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc47Q9D024 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc47Q9D024 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc47Q9D024 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc47Q9D024 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc47Q9D024 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc47Q9D024 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc47Q9D024 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc47Q9D024 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc47Q9D024 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc47Q9D024 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc47Q9D024 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc47Q9D024 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc47Q9D024 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc47Q9D024 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc47Q9D024 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc47Q9D024 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc47Q9D024 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc47Q9D024 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc47Q9D024 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc47Q9D024 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc47Q9D024 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc47Q9D024 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc47Q9D024 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc47Q9D024 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc47Q9D024 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc47Q9D024 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc47Q9D024 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc47Q9D024 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc47Q9D024 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc47Q9D024 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc47Q9D024 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc47Q9D024 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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