Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZT8

Rab3b, Ras-related protein Rab-3B, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3bQ9CZT8 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rab3bQ9CZT8 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rab3bQ9CZT8 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab3bQ9CZT8 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab3bQ9CZT8 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab3bQ9CZT8 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab3bQ9CZT8 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab3bQ9CZT8 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab3bQ9CZT8 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab3bQ9CZT8 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab3bQ9CZT8 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab3bQ9CZT8 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab3bQ9CZT8 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab3bQ9CZT8 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab3bQ9CZT8 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab3bQ9CZT8 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab3bQ9CZT8 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab3bQ9CZT8 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab3bQ9CZT8 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab3bQ9CZT8 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab3bQ9CZT8 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab3bQ9CZT8 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab3bQ9CZT8 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab3bQ9CZT8 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab3bQ9CZT8 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab3bQ9CZT8 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab3bQ9CZT8 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab3bQ9CZT8 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab3bQ9CZT8 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab3bQ9CZT8 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab3bQ9CZT8 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab3bQ9CZT8 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab3bQ9CZT8 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab3bQ9CZT8 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab3bQ9CZT8 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab3bQ9CZT8 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab3bQ9CZT8 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab3bQ9CZT8 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab3bQ9CZT8 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab3bQ9CZT8 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab3bQ9CZT8 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab3bQ9CZT8 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab3bQ9CZT8 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab3bQ9CZT8 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab3bQ9CZT8 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab3bQ9CZT8 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab3bQ9CZT8 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab3bQ9CZT8 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab3bQ9CZT8 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab3bQ9CZT8 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab3bQ9CZT8 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab3bQ9CZT8 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab3bQ9CZT8 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab3bQ9CZT8 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab3bQ9CZT8 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab3bQ9CZT8 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab3bQ9CZT8 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab3bQ9CZT8 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab3bQ9CZT8 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab3bQ9CZT8 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab3bQ9CZT8 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab3bQ9CZT8 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab3bQ9CZT8 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab3bQ9CZT8 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab3bQ9CZT8 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab3bQ9CZT8 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab3bQ9CZT8 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab3bQ9CZT8 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab3bQ9CZT8 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab3bQ9CZT8 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab3bQ9CZT8 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab3bQ9CZT8 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab3bQ9CZT8 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab3bQ9CZT8 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab3bQ9CZT8 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab3bQ9CZT8 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab3bQ9CZT8 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab3bQ9CZT8 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab3bQ9CZT8 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab3bQ9CZT8 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab3bQ9CZT8 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab3bQ9CZT8 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab3bQ9CZT8 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab3bQ9CZT8 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab3bQ9CZT8 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab3bQ9CZT8 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab3bQ9CZT8 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab3bQ9CZT8 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab3bQ9CZT8 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab3bQ9CZT8 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab3bQ9CZT8 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab3bQ9CZT8 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab3bQ9CZT8 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab3bQ9CZT8 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab3bQ9CZT8 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rab3bQ9CZT8 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rab3bQ9CZT8 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rab3bQ9CZT8 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rab3bQ9CZT8 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rab3bQ9CZT8 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms