Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE6

Xrcc3, DNA repair protein XRCC3, mousemouse

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Length 349 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc3Q9CXE6 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Xrcc3Q9CXE6 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Xrcc3Q9CXE6 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Xrcc3Q9CXE6 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Xrcc3Q9CXE6 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Xrcc3Q9CXE6 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Xrcc3Q9CXE6 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Xrcc3Q9CXE6 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Xrcc3Q9CXE6 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Xrcc3Q9CXE6 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Xrcc3Q9CXE6 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Xrcc3Q9CXE6 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Xrcc3Q9CXE6 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Xrcc3Q9CXE6 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Xrcc3Q9CXE6 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Xrcc3Q9CXE6 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Xrcc3Q9CXE6 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Xrcc3Q9CXE6 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Xrcc3Q9CXE6 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Xrcc3Q9CXE6 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Xrcc3Q9CXE6 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Xrcc3Q9CXE6 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Xrcc3Q9CXE6 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Xrcc3Q9CXE6 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Xrcc3Q9CXE6 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Xrcc3Q9CXE6 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Xrcc3Q9CXE6 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
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Xrcc3Q9CXE6 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Xrcc3Q9CXE6 Ptpn11-201ENSMUST00000054547 5535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Xrcc3Q9CXE6 AC122291.1-201ENSMUST00000228937 5748 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Xrcc3Q9CXE6 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Xrcc3Q9CXE6 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Xrcc3Q9CXE6 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Xrcc3Q9CXE6 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Xrcc3Q9CXE6 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Xrcc3Q9CXE6 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Xrcc3Q9CXE6 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
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Xrcc3Q9CXE6 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Xrcc3Q9CXE6 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
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Xrcc3Q9CXE6 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Xrcc3Q9CXE6 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Xrcc3Q9CXE6 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
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Xrcc3Q9CXE6 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
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Xrcc3Q9CXE6 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Xrcc3Q9CXE6 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
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Xrcc3Q9CXE6 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
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Xrcc3Q9CXE6 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Xrcc3Q9CXE6 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
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Xrcc3Q9CXE6 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Xrcc3Q9CXE6 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Xrcc3Q9CXE6 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Xrcc3Q9CXE6 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
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Xrcc3Q9CXE6 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Xrcc3Q9CXE6 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Xrcc3Q9CXE6 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Xrcc3Q9CXE6 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Xrcc3Q9CXE6 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Xrcc3Q9CXE6 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Xrcc3Q9CXE6 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Xrcc3Q9CXE6 Gm37660-201ENSMUST00000192754 1732 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Xrcc3Q9CXE6 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
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Xrcc3Q9CXE6 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Xrcc3Q9CXE6 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
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