Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWV6

Prkrip1, PRKR-interacting protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkrip1Q9CWV6 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prkrip1Q9CWV6 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Prkrip1Q9CWV6 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prkrip1Q9CWV6 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prkrip1Q9CWV6 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prkrip1Q9CWV6 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prkrip1Q9CWV6 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Prkrip1Q9CWV6 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prkrip1Q9CWV6 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prkrip1Q9CWV6 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Prkrip1Q9CWV6 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prkrip1Q9CWV6 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prkrip1Q9CWV6 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prkrip1Q9CWV6 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prkrip1Q9CWV6 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prkrip1Q9CWV6 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prkrip1Q9CWV6 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prkrip1Q9CWV6 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prkrip1Q9CWV6 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prkrip1Q9CWV6 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Prkrip1Q9CWV6 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prkrip1Q9CWV6 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prkrip1Q9CWV6 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prkrip1Q9CWV6 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prkrip1Q9CWV6 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prkrip1Q9CWV6 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prkrip1Q9CWV6 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prkrip1Q9CWV6 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prkrip1Q9CWV6 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prkrip1Q9CWV6 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prkrip1Q9CWV6 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prkrip1Q9CWV6 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prkrip1Q9CWV6 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prkrip1Q9CWV6 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prkrip1Q9CWV6 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prkrip1Q9CWV6 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prkrip1Q9CWV6 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prkrip1Q9CWV6 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prkrip1Q9CWV6 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prkrip1Q9CWV6 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Prkrip1Q9CWV6 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prkrip1Q9CWV6 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prkrip1Q9CWV6 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prkrip1Q9CWV6 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Prkrip1Q9CWV6 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Prkrip1Q9CWV6 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prkrip1Q9CWV6 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prkrip1Q9CWV6 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Prkrip1Q9CWV6 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Prkrip1Q9CWV6 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prkrip1Q9CWV6 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prkrip1Q9CWV6 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Prkrip1Q9CWV6 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prkrip1Q9CWV6 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prkrip1Q9CWV6 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prkrip1Q9CWV6 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prkrip1Q9CWV6 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prkrip1Q9CWV6 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prkrip1Q9CWV6 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prkrip1Q9CWV6 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prkrip1Q9CWV6 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prkrip1Q9CWV6 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prkrip1Q9CWV6 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prkrip1Q9CWV6 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prkrip1Q9CWV6 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prkrip1Q9CWV6 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prkrip1Q9CWV6 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prkrip1Q9CWV6 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prkrip1Q9CWV6 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prkrip1Q9CWV6 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prkrip1Q9CWV6 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prkrip1Q9CWV6 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prkrip1Q9CWV6 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prkrip1Q9CWV6 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prkrip1Q9CWV6 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prkrip1Q9CWV6 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prkrip1Q9CWV6 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prkrip1Q9CWV6 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prkrip1Q9CWV6 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prkrip1Q9CWV6 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prkrip1Q9CWV6 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prkrip1Q9CWV6 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prkrip1Q9CWV6 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prkrip1Q9CWV6 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Prkrip1Q9CWV6 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prkrip1Q9CWV6 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prkrip1Q9CWV6 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prkrip1Q9CWV6 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prkrip1Q9CWV6 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prkrip1Q9CWV6 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prkrip1Q9CWV6 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prkrip1Q9CWV6 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prkrip1Q9CWV6 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prkrip1Q9CWV6 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prkrip1Q9CWV6 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Prkrip1Q9CWV6 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prkrip1Q9CWV6 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Prkrip1Q9CWV6 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Prkrip1Q9CWV6 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Prkrip1Q9CWV6 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.4 ms