Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWT6

Ddx28, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx28Q9CWT6 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ddx28Q9CWT6 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ddx28Q9CWT6 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ddx28Q9CWT6 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ddx28Q9CWT6 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ddx28Q9CWT6 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ddx28Q9CWT6 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ddx28Q9CWT6 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Ddx28Q9CWT6 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ddx28Q9CWT6 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ddx28Q9CWT6 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ddx28Q9CWT6 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Ddx28Q9CWT6 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ddx28Q9CWT6 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ddx28Q9CWT6 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ddx28Q9CWT6 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ddx28Q9CWT6 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ddx28Q9CWT6 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ddx28Q9CWT6 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ddx28Q9CWT6 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ddx28Q9CWT6 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ddx28Q9CWT6 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ddx28Q9CWT6 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ddx28Q9CWT6 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ddx28Q9CWT6 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ddx28Q9CWT6 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ddx28Q9CWT6 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ddx28Q9CWT6 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ddx28Q9CWT6 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ddx28Q9CWT6 Atic-201ENSMUST00000027384 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ddx28Q9CWT6 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ddx28Q9CWT6 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ddx28Q9CWT6 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ddx28Q9CWT6 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Ddx28Q9CWT6 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ddx28Q9CWT6 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ddx28Q9CWT6 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ddx28Q9CWT6 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ddx28Q9CWT6 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ddx28Q9CWT6 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ddx28Q9CWT6 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ddx28Q9CWT6 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ddx28Q9CWT6 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ddx28Q9CWT6 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ddx28Q9CWT6 2410002F23Rik-204ENSMUST00000107948 2908 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ddx28Q9CWT6 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ddx28Q9CWT6 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ddx28Q9CWT6 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ddx28Q9CWT6 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ddx28Q9CWT6 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ddx28Q9CWT6 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ddx28Q9CWT6 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ddx28Q9CWT6 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ddx28Q9CWT6 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ddx28Q9CWT6 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ddx28Q9CWT6 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ddx28Q9CWT6 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ddx28Q9CWT6 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Ddx28Q9CWT6 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ddx28Q9CWT6 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ddx28Q9CWT6 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Ddx28Q9CWT6 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ddx28Q9CWT6 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ddx28Q9CWT6 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ddx28Q9CWT6 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ddx28Q9CWT6 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
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Ddx28Q9CWT6 Cic-212ENSMUST00000169266 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ddx28Q9CWT6 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ddx28Q9CWT6 Sgk1-203ENSMUST00000100036 2476 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ddx28Q9CWT6 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ddx28Q9CWT6 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ddx28Q9CWT6 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ddx28Q9CWT6 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ddx28Q9CWT6 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ddx28Q9CWT6 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ddx28Q9CWT6 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ddx28Q9CWT6 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ddx28Q9CWT6 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Ddx28Q9CWT6 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ddx28Q9CWT6 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ddx28Q9CWT6 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ddx28Q9CWT6 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ddx28Q9CWT6 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ddx28Q9CWT6 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ddx28Q9CWT6 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ddx28Q9CWT6 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ddx28Q9CWT6 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ddx28Q9CWT6 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Ddx28Q9CWT6 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ddx28Q9CWT6 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ddx28Q9CWT6 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ddx28Q9CWT6 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ddx28Q9CWT6 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ddx28Q9CWT6 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ddx28Q9CWT6 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ddx28Q9CWT6 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ddx28Q9CWT6 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ddx28Q9CWT6 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ddx28Q9CWT6 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
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