Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWD8

Nubpl, Iron-sulfur protein NUBPL, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NubplQ9CWD8 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
NubplQ9CWD8 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
NubplQ9CWD8 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.55
NubplQ9CWD8 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
NubplQ9CWD8 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
NubplQ9CWD8 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
NubplQ9CWD8 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
NubplQ9CWD8 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
NubplQ9CWD8 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
NubplQ9CWD8 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
NubplQ9CWD8 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
NubplQ9CWD8 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
NubplQ9CWD8 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
NubplQ9CWD8 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
NubplQ9CWD8 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
NubplQ9CWD8 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
NubplQ9CWD8 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
NubplQ9CWD8 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
NubplQ9CWD8 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
NubplQ9CWD8 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
NubplQ9CWD8 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
NubplQ9CWD8 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
NubplQ9CWD8 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
NubplQ9CWD8 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
NubplQ9CWD8 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
NubplQ9CWD8 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
NubplQ9CWD8 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
NubplQ9CWD8 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
NubplQ9CWD8 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
NubplQ9CWD8 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
NubplQ9CWD8 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
NubplQ9CWD8 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
NubplQ9CWD8 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
NubplQ9CWD8 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
NubplQ9CWD8 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
NubplQ9CWD8 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
NubplQ9CWD8 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
NubplQ9CWD8 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
NubplQ9CWD8 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
NubplQ9CWD8 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
NubplQ9CWD8 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
NubplQ9CWD8 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
NubplQ9CWD8 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
NubplQ9CWD8 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
NubplQ9CWD8 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
NubplQ9CWD8 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
NubplQ9CWD8 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
NubplQ9CWD8 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
NubplQ9CWD8 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
NubplQ9CWD8 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
NubplQ9CWD8 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
NubplQ9CWD8 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
NubplQ9CWD8 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
NubplQ9CWD8 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
NubplQ9CWD8 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
NubplQ9CWD8 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
NubplQ9CWD8 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
NubplQ9CWD8 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
NubplQ9CWD8 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
NubplQ9CWD8 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
NubplQ9CWD8 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
NubplQ9CWD8 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
NubplQ9CWD8 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
NubplQ9CWD8 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
NubplQ9CWD8 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
NubplQ9CWD8 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
NubplQ9CWD8 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
NubplQ9CWD8 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
NubplQ9CWD8 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
NubplQ9CWD8 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
NubplQ9CWD8 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
NubplQ9CWD8 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
NubplQ9CWD8 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
NubplQ9CWD8 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
NubplQ9CWD8 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
NubplQ9CWD8 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
NubplQ9CWD8 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
NubplQ9CWD8 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
NubplQ9CWD8 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
NubplQ9CWD8 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
NubplQ9CWD8 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
NubplQ9CWD8 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
NubplQ9CWD8 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
NubplQ9CWD8 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
NubplQ9CWD8 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
NubplQ9CWD8 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
NubplQ9CWD8 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
NubplQ9CWD8 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
NubplQ9CWD8 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
NubplQ9CWD8 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
NubplQ9CWD8 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
NubplQ9CWD8 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
NubplQ9CWD8 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
NubplQ9CWD8 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
NubplQ9CWD8 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
NubplQ9CWD8 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
NubplQ9CWD8 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
NubplQ9CWD8 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
NubplQ9CWD8 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
NubplQ9CWD8 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 569.8 ms