Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQT5

Pomp, Proteasome maturation protein, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PompQ9CQT5 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PompQ9CQT5 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PompQ9CQT5 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PompQ9CQT5 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PompQ9CQT5 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
PompQ9CQT5 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.43
PompQ9CQT5 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PompQ9CQT5 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PompQ9CQT5 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PompQ9CQT5 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PompQ9CQT5 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
PompQ9CQT5 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PompQ9CQT5 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PompQ9CQT5 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PompQ9CQT5 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PompQ9CQT5 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PompQ9CQT5 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PompQ9CQT5 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PompQ9CQT5 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
PompQ9CQT5 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PompQ9CQT5 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
PompQ9CQT5 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
PompQ9CQT5 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PompQ9CQT5 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
PompQ9CQT5 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
PompQ9CQT5 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
PompQ9CQT5 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PompQ9CQT5 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PompQ9CQT5 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PompQ9CQT5 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PompQ9CQT5 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PompQ9CQT5 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PompQ9CQT5 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PompQ9CQT5 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PompQ9CQT5 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PompQ9CQT5 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PompQ9CQT5 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
PompQ9CQT5 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PompQ9CQT5 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PompQ9CQT5 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PompQ9CQT5 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PompQ9CQT5 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PompQ9CQT5 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
PompQ9CQT5 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PompQ9CQT5 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PompQ9CQT5 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PompQ9CQT5 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PompQ9CQT5 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PompQ9CQT5 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PompQ9CQT5 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PompQ9CQT5 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PompQ9CQT5 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PompQ9CQT5 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
PompQ9CQT5 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PompQ9CQT5 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PompQ9CQT5 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PompQ9CQT5 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PompQ9CQT5 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PompQ9CQT5 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PompQ9CQT5 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PompQ9CQT5 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PompQ9CQT5 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PompQ9CQT5 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PompQ9CQT5 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PompQ9CQT5 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PompQ9CQT5 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PompQ9CQT5 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PompQ9CQT5 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PompQ9CQT5 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PompQ9CQT5 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PompQ9CQT5 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
PompQ9CQT5 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PompQ9CQT5 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PompQ9CQT5 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
PompQ9CQT5 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PompQ9CQT5 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PompQ9CQT5 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
PompQ9CQT5 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PompQ9CQT5 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PompQ9CQT5 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PompQ9CQT5 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PompQ9CQT5 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PompQ9CQT5 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PompQ9CQT5 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PompQ9CQT5 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PompQ9CQT5 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PompQ9CQT5 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PompQ9CQT5 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PompQ9CQT5 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PompQ9CQT5 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PompQ9CQT5 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PompQ9CQT5 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PompQ9CQT5 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PompQ9CQT5 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
PompQ9CQT5 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PompQ9CQT5 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PompQ9CQT5 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PompQ9CQT5 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PompQ9CQT5 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PompQ9CQT5 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms