Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQP3

Chchd5, Coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 110 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chchd5Q9CQP3 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Chchd5Q9CQP3 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Chchd5Q9CQP3 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Chchd5Q9CQP3 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Chchd5Q9CQP3 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Chchd5Q9CQP3 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Chchd5Q9CQP3 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Chchd5Q9CQP3 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Chchd5Q9CQP3 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Chchd5Q9CQP3 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Chchd5Q9CQP3 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Chchd5Q9CQP3 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Chchd5Q9CQP3 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Chchd5Q9CQP3 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Chchd5Q9CQP3 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Chchd5Q9CQP3 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Chchd5Q9CQP3 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Chchd5Q9CQP3 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Chchd5Q9CQP3 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Chchd5Q9CQP3 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Chchd5Q9CQP3 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Chchd5Q9CQP3 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Chchd5Q9CQP3 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Chchd5Q9CQP3 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Chchd5Q9CQP3 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Chchd5Q9CQP3 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Chchd5Q9CQP3 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Chchd5Q9CQP3 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Chchd5Q9CQP3 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Chchd5Q9CQP3 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Chchd5Q9CQP3 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Chchd5Q9CQP3 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Chchd5Q9CQP3 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Chchd5Q9CQP3 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Chchd5Q9CQP3 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Chchd5Q9CQP3 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Chchd5Q9CQP3 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Chchd5Q9CQP3 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Chchd5Q9CQP3 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Chchd5Q9CQP3 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Chchd5Q9CQP3 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Chchd5Q9CQP3 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Chchd5Q9CQP3 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Chchd5Q9CQP3 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Chchd5Q9CQP3 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Chchd5Q9CQP3 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Chchd5Q9CQP3 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Chchd5Q9CQP3 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Chchd5Q9CQP3 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Chchd5Q9CQP3 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Chchd5Q9CQP3 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Chchd5Q9CQP3 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Chchd5Q9CQP3 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Chchd5Q9CQP3 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Chchd5Q9CQP3 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Chchd5Q9CQP3 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Chchd5Q9CQP3 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Chchd5Q9CQP3 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Chchd5Q9CQP3 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Chchd5Q9CQP3 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Chchd5Q9CQP3 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Chchd5Q9CQP3 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Chchd5Q9CQP3 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Chchd5Q9CQP3 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Chchd5Q9CQP3 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Chchd5Q9CQP3 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Chchd5Q9CQP3 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Chchd5Q9CQP3 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Chchd5Q9CQP3 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Chchd5Q9CQP3 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Chchd5Q9CQP3 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Chchd5Q9CQP3 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Chchd5Q9CQP3 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Chchd5Q9CQP3 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Chchd5Q9CQP3 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Chchd5Q9CQP3 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Chchd5Q9CQP3 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Chchd5Q9CQP3 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Chchd5Q9CQP3 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Chchd5Q9CQP3 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Chchd5Q9CQP3 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Chchd5Q9CQP3 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Chchd5Q9CQP3 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Chchd5Q9CQP3 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Chchd5Q9CQP3 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Chchd5Q9CQP3 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Chchd5Q9CQP3 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Chchd5Q9CQP3 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Chchd5Q9CQP3 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Chchd5Q9CQP3 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Chchd5Q9CQP3 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Chchd5Q9CQP3 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Chchd5Q9CQP3 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Chchd5Q9CQP3 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Chchd5Q9CQP3 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Chchd5Q9CQP3 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Chchd5Q9CQP3 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Chchd5Q9CQP3 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Chchd5Q9CQP3 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Chchd5Q9CQP3 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms