Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ07

Lrrc18, Leucine-rich repeat-containing protein 18, mousemouse

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Length 262 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc18Q9CQ07 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lrrc18Q9CQ07 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lrrc18Q9CQ07 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lrrc18Q9CQ07 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lrrc18Q9CQ07 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lrrc18Q9CQ07 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lrrc18Q9CQ07 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lrrc18Q9CQ07 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lrrc18Q9CQ07 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lrrc18Q9CQ07 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Lrrc18Q9CQ07 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Lrrc18Q9CQ07 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Lrrc18Q9CQ07 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Lrrc18Q9CQ07 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Lrrc18Q9CQ07 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Lrrc18Q9CQ07 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Lrrc18Q9CQ07 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Lrrc18Q9CQ07 Fubp1-209ENSMUST00000198227 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Lrrc18Q9CQ07 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
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Lrrc18Q9CQ07 Klhl29-202ENSMUST00000218384 2716 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
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Lrrc18Q9CQ07 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Lrrc18Q9CQ07 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Lrrc18Q9CQ07 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Lrrc18Q9CQ07 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Lrrc18Q9CQ07 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Lrrc18Q9CQ07 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Lrrc18Q9CQ07 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Lrrc18Q9CQ07 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Lrrc18Q9CQ07 AC153506.1-201ENSMUST00000218768 2915 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Lrrc18Q9CQ07 Hexim1-201ENSMUST00000053063 3495 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Lrrc18Q9CQ07 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Lrrc18Q9CQ07 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Lrrc18Q9CQ07 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Lrrc18Q9CQ07 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Lrrc18Q9CQ07 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Lrrc18Q9CQ07 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Lrrc18Q9CQ07 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Lrrc18Q9CQ07 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
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