Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR4

Rpl17, 60S ribosomal protein L17, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 184 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl17Q9CPR4 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rpl17Q9CPR4 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Rpl17Q9CPR4 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rpl17Q9CPR4 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rpl17Q9CPR4 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rpl17Q9CPR4 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rpl17Q9CPR4 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rpl17Q9CPR4 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rpl17Q9CPR4 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rpl17Q9CPR4 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rpl17Q9CPR4 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rpl17Q9CPR4 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rpl17Q9CPR4 Rangap1-202ENSMUST00000170134 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rpl17Q9CPR4 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rpl17Q9CPR4 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rpl17Q9CPR4 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rpl17Q9CPR4 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rpl17Q9CPR4 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rpl17Q9CPR4 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rpl17Q9CPR4 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rpl17Q9CPR4 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rpl17Q9CPR4 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rpl17Q9CPR4 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rpl17Q9CPR4 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rpl17Q9CPR4 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rpl17Q9CPR4 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rpl17Q9CPR4 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rpl17Q9CPR4 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rpl17Q9CPR4 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rpl17Q9CPR4 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rpl17Q9CPR4 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rpl17Q9CPR4 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rpl17Q9CPR4 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rpl17Q9CPR4 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rpl17Q9CPR4 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rpl17Q9CPR4 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rpl17Q9CPR4 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rpl17Q9CPR4 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rpl17Q9CPR4 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rpl17Q9CPR4 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rpl17Q9CPR4 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rpl17Q9CPR4 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rpl17Q9CPR4 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rpl17Q9CPR4 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rpl17Q9CPR4 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rpl17Q9CPR4 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rpl17Q9CPR4 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rpl17Q9CPR4 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rpl17Q9CPR4 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rpl17Q9CPR4 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rpl17Q9CPR4 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rpl17Q9CPR4 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rpl17Q9CPR4 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rpl17Q9CPR4 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rpl17Q9CPR4 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rpl17Q9CPR4 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Rpl17Q9CPR4 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Rpl17Q9CPR4 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC13.15□□□□□ -0.31
Rpl17Q9CPR4 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Rpl17Q9CPR4 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Rpl17Q9CPR4 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Rpl17Q9CPR4 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpl17Q9CPR4 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpl17Q9CPR4 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpl17Q9CPR4 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpl17Q9CPR4 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpl17Q9CPR4 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpl17Q9CPR4 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpl17Q9CPR4 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpl17Q9CPR4 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpl17Q9CPR4 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpl17Q9CPR4 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpl17Q9CPR4 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpl17Q9CPR4 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpl17Q9CPR4 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpl17Q9CPR4 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpl17Q9CPR4 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpl17Q9CPR4 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpl17Q9CPR4 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpl17Q9CPR4 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpl17Q9CPR4 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpl17Q9CPR4 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpl17Q9CPR4 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpl17Q9CPR4 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpl17Q9CPR4 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpl17Q9CPR4 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpl17Q9CPR4 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpl17Q9CPR4 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpl17Q9CPR4 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpl17Q9CPR4 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpl17Q9CPR4 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpl17Q9CPR4 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpl17Q9CPR4 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpl17Q9CPR4 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpl17Q9CPR4 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpl17Q9CPR4 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpl17Q9CPR4 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpl17Q9CPR4 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpl17Q9CPR4 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpl17Q9CPR4 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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