Protein–RNA interactions for Protein: Q99PE5

Smim3, Small integral membrane protein 3, mousemouse

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Length 60 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim3Q99PE5 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Smim3Q99PE5 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Smim3Q99PE5 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Smim3Q99PE5 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Smim3Q99PE5 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Smim3Q99PE5 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Smim3Q99PE5 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Smim3Q99PE5 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Smim3Q99PE5 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Smim3Q99PE5 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Smim3Q99PE5 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Smim3Q99PE5 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Smim3Q99PE5 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Smim3Q99PE5 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Smim3Q99PE5 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Smim3Q99PE5 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Smim3Q99PE5 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Smim3Q99PE5 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Smim3Q99PE5 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Smim3Q99PE5 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Smim3Q99PE5 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Smim3Q99PE5 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Smim3Q99PE5 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Smim3Q99PE5 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Smim3Q99PE5 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Smim3Q99PE5 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Smim3Q99PE5 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Smim3Q99PE5 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Smim3Q99PE5 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Smim3Q99PE5 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Smim3Q99PE5 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Smim3Q99PE5 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Smim3Q99PE5 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Smim3Q99PE5 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Smim3Q99PE5 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Smim3Q99PE5 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Smim3Q99PE5 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Smim3Q99PE5 Dnajc5-203ENSMUST00000108797 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Smim3Q99PE5 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Smim3Q99PE5 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Smim3Q99PE5 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Smim3Q99PE5 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Smim3Q99PE5 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Smim3Q99PE5 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Smim3Q99PE5 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Smim3Q99PE5 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Smim3Q99PE5 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Smim3Q99PE5 Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 6961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Smim3Q99PE5 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Smim3Q99PE5 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Smim3Q99PE5 Iqsec1-201ENSMUST00000101151 6490 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Smim3Q99PE5 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Smim3Q99PE5 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Smim3Q99PE5 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Smim3Q99PE5 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Smim3Q99PE5 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Smim3Q99PE5 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Smim3Q99PE5 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Smim3Q99PE5 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Smim3Q99PE5 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Smim3Q99PE5 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Smim3Q99PE5 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Smim3Q99PE5 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Smim3Q99PE5 Gm26778-201ENSMUST00000181443 3805 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
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Smim3Q99PE5 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Smim3Q99PE5 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Smim3Q99PE5 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Smim3Q99PE5 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Smim3Q99PE5 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Smim3Q99PE5 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
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Smim3Q99PE5 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Smim3Q99PE5 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Smim3Q99PE5 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Smim3Q99PE5 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Smim3Q99PE5 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Smim3Q99PE5 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Smim3Q99PE5 Gm14137-201ENSMUST00000069711 3067 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Smim3Q99PE5 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Smim3Q99PE5 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Smim3Q99PE5 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Smim3Q99PE5 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Smim3Q99PE5 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Smim3Q99PE5 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Smim3Q99PE5 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Smim3Q99PE5 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Smim3Q99PE5 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Smim3Q99PE5 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Smim3Q99PE5 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Smim3Q99PE5 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Smim3Q99PE5 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Smim3Q99PE5 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Smim3Q99PE5 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Smim3Q99PE5 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Smim3Q99PE5 Cad-203ENSMUST00000200953 6489 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Smim3Q99PE5 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Smim3Q99PE5 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Smim3Q99PE5 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Smim3Q99PE5 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
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