Protein–RNA interactions for Protein: Q99NB9

Sf3b1, Splicing factor 3B subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b1Q99NB9 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sf3b1Q99NB9 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sf3b1Q99NB9 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sf3b1Q99NB9 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sf3b1Q99NB9 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sf3b1Q99NB9 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sf3b1Q99NB9 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sf3b1Q99NB9 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sf3b1Q99NB9 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sf3b1Q99NB9 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sf3b1Q99NB9 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sf3b1Q99NB9 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sf3b1Q99NB9 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sf3b1Q99NB9 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sf3b1Q99NB9 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sf3b1Q99NB9 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sf3b1Q99NB9 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sf3b1Q99NB9 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sf3b1Q99NB9 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sf3b1Q99NB9 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sf3b1Q99NB9 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sf3b1Q99NB9 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sf3b1Q99NB9 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sf3b1Q99NB9 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Sf3b1Q99NB9 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sf3b1Q99NB9 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sf3b1Q99NB9 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sf3b1Q99NB9 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sf3b1Q99NB9 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Sf3b1Q99NB9 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sf3b1Q99NB9 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sf3b1Q99NB9 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sf3b1Q99NB9 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sf3b1Q99NB9 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Sf3b1Q99NB9 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sf3b1Q99NB9 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sf3b1Q99NB9 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sf3b1Q99NB9 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sf3b1Q99NB9 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sf3b1Q99NB9 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sf3b1Q99NB9 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sf3b1Q99NB9 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sf3b1Q99NB9 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sf3b1Q99NB9 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sf3b1Q99NB9 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sf3b1Q99NB9 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sf3b1Q99NB9 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sf3b1Q99NB9 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sf3b1Q99NB9 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sf3b1Q99NB9 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sf3b1Q99NB9 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sf3b1Q99NB9 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sf3b1Q99NB9 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sf3b1Q99NB9 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sf3b1Q99NB9 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sf3b1Q99NB9 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sf3b1Q99NB9 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sf3b1Q99NB9 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sf3b1Q99NB9 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sf3b1Q99NB9 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sf3b1Q99NB9 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Sf3b1Q99NB9 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sf3b1Q99NB9 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sf3b1Q99NB9 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sf3b1Q99NB9 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sf3b1Q99NB9 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sf3b1Q99NB9 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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Sf3b1Q99NB9 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Sf3b1Q99NB9 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sf3b1Q99NB9 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sf3b1Q99NB9 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sf3b1Q99NB9 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sf3b1Q99NB9 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sf3b1Q99NB9 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sf3b1Q99NB9 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sf3b1Q99NB9 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sf3b1Q99NB9 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sf3b1Q99NB9 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sf3b1Q99NB9 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sf3b1Q99NB9 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Sf3b1Q99NB9 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sf3b1Q99NB9 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sf3b1Q99NB9 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sf3b1Q99NB9 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sf3b1Q99NB9 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Sf3b1Q99NB9 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sf3b1Q99NB9 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sf3b1Q99NB9 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sf3b1Q99NB9 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sf3b1Q99NB9 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sf3b1Q99NB9 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sf3b1Q99NB9 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sf3b1Q99NB9 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sf3b1Q99NB9 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sf3b1Q99NB9 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Sf3b1Q99NB9 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sf3b1Q99NB9 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sf3b1Q99NB9 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sf3b1Q99NB9 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.4 ms