Protein–RNA interactions for Protein: Q99N07

Ms4a6d, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 6D, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a6dQ99N07 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Ms4a6dQ99N07 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ms4a6dQ99N07 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ms4a6dQ99N07 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Ms4a6dQ99N07 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ms4a6dQ99N07 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ms4a6dQ99N07 Slc13a5-205ENSMUST00000208056 3111 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ms4a6dQ99N07 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ms4a6dQ99N07 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ms4a6dQ99N07 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ms4a6dQ99N07 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ms4a6dQ99N07 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ms4a6dQ99N07 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ms4a6dQ99N07 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Ms4a6dQ99N07 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ms4a6dQ99N07 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ms4a6dQ99N07 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ms4a6dQ99N07 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ms4a6dQ99N07 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ms4a6dQ99N07 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ms4a6dQ99N07 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ms4a6dQ99N07 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ms4a6dQ99N07 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ms4a6dQ99N07 AC211878.3-201ENSMUST00000222629 2018 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Ms4a6dQ99N07 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ms4a6dQ99N07 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ms4a6dQ99N07 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ms4a6dQ99N07 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ms4a6dQ99N07 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ms4a6dQ99N07 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ms4a6dQ99N07 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ms4a6dQ99N07 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ms4a6dQ99N07 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ms4a6dQ99N07 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ms4a6dQ99N07 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Ms4a6dQ99N07 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ms4a6dQ99N07 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ms4a6dQ99N07 Klhl22-208ENSMUST00000165790 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ms4a6dQ99N07 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ms4a6dQ99N07 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ms4a6dQ99N07 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ms4a6dQ99N07 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ms4a6dQ99N07 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ms4a6dQ99N07 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ms4a6dQ99N07 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ms4a6dQ99N07 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ms4a6dQ99N07 Slc10a7-201ENSMUST00000034111 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ms4a6dQ99N07 Cuzd1-201ENSMUST00000046611 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ms4a6dQ99N07 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ms4a6dQ99N07 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ms4a6dQ99N07 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ms4a6dQ99N07 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ms4a6dQ99N07 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ms4a6dQ99N07 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ms4a6dQ99N07 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ms4a6dQ99N07 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ms4a6dQ99N07 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ms4a6dQ99N07 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ms4a6dQ99N07 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ms4a6dQ99N07 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ms4a6dQ99N07 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ms4a6dQ99N07 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Ms4a6dQ99N07 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ms4a6dQ99N07 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ms4a6dQ99N07 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ms4a6dQ99N07 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ms4a6dQ99N07 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Ms4a6dQ99N07 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Ms4a6dQ99N07 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ms4a6dQ99N07 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ms4a6dQ99N07 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ms4a6dQ99N07 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ms4a6dQ99N07 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ms4a6dQ99N07 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ms4a6dQ99N07 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Ms4a6dQ99N07 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ms4a6dQ99N07 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ms4a6dQ99N07 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ms4a6dQ99N07 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ms4a6dQ99N07 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ms4a6dQ99N07 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ms4a6dQ99N07 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ms4a6dQ99N07 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ms4a6dQ99N07 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ms4a6dQ99N07 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ms4a6dQ99N07 Sez6l-206ENSMUST00000212758 2664 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ms4a6dQ99N07 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ms4a6dQ99N07 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ms4a6dQ99N07 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ms4a6dQ99N07 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ms4a6dQ99N07 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.71
Ms4a6dQ99N07 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.71
Ms4a6dQ99N07 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ms4a6dQ99N07 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ms4a6dQ99N07 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ms4a6dQ99N07 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ms4a6dQ99N07 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ms4a6dQ99N07 Smtn-210ENSMUST00000170588 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ms4a6dQ99N07 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ms4a6dQ99N07 AC166359.1-201ENSMUST00000220243 1871 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms