Protein–RNA interactions for Protein: Q99MR6

Srrt, Serrate RNA effector molecule homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 875 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrrtQ99MR6 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SrrtQ99MR6 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SrrtQ99MR6 Gm20614-201ENSMUST00000177106 632 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
SrrtQ99MR6 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SrrtQ99MR6 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
SrrtQ99MR6 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SrrtQ99MR6 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SrrtQ99MR6 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SrrtQ99MR6 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
SrrtQ99MR6 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SrrtQ99MR6 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SrrtQ99MR6 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SrrtQ99MR6 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SrrtQ99MR6 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SrrtQ99MR6 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SrrtQ99MR6 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SrrtQ99MR6 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SrrtQ99MR6 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SrrtQ99MR6 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SrrtQ99MR6 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SrrtQ99MR6 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SrrtQ99MR6 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SrrtQ99MR6 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SrrtQ99MR6 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SrrtQ99MR6 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SrrtQ99MR6 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SrrtQ99MR6 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SrrtQ99MR6 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SrrtQ99MR6 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SrrtQ99MR6 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SrrtQ99MR6 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SrrtQ99MR6 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SrrtQ99MR6 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SrrtQ99MR6 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SrrtQ99MR6 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SrrtQ99MR6 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SrrtQ99MR6 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
SrrtQ99MR6 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SrrtQ99MR6 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SrrtQ99MR6 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
SrrtQ99MR6 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SrrtQ99MR6 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SrrtQ99MR6 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SrrtQ99MR6 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SrrtQ99MR6 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SrrtQ99MR6 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SrrtQ99MR6 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SrrtQ99MR6 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SrrtQ99MR6 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SrrtQ99MR6 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SrrtQ99MR6 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SrrtQ99MR6 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SrrtQ99MR6 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SrrtQ99MR6 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SrrtQ99MR6 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SrrtQ99MR6 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SrrtQ99MR6 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SrrtQ99MR6 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SrrtQ99MR6 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
SrrtQ99MR6 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SrrtQ99MR6 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SrrtQ99MR6 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SrrtQ99MR6 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SrrtQ99MR6 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SrrtQ99MR6 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SrrtQ99MR6 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SrrtQ99MR6 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SrrtQ99MR6 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SrrtQ99MR6 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SrrtQ99MR6 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SrrtQ99MR6 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SrrtQ99MR6 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SrrtQ99MR6 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SrrtQ99MR6 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SrrtQ99MR6 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SrrtQ99MR6 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SrrtQ99MR6 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SrrtQ99MR6 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SrrtQ99MR6 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
SrrtQ99MR6 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SrrtQ99MR6 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SrrtQ99MR6 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SrrtQ99MR6 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
SrrtQ99MR6 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SrrtQ99MR6 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SrrtQ99MR6 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SrrtQ99MR6 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SrrtQ99MR6 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SrrtQ99MR6 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SrrtQ99MR6 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SrrtQ99MR6 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SrrtQ99MR6 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SrrtQ99MR6 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SrrtQ99MR6 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SrrtQ99MR6 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SrrtQ99MR6 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SrrtQ99MR6 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SrrtQ99MR6 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SrrtQ99MR6 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SrrtQ99MR6 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms