Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME6

Atp1b4, Protein ATP1B4, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1b4Q99ME6 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atp1b4Q99ME6 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atp1b4Q99ME6 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atp1b4Q99ME6 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atp1b4Q99ME6 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Atp1b4Q99ME6 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atp1b4Q99ME6 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Atp1b4Q99ME6 Gm13010-201ENSMUST00000140495 828 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atp1b4Q99ME6 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atp1b4Q99ME6 Gm19459-201ENSMUST00000176240 835 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Atp1b4Q99ME6 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atp1b4Q99ME6 Gm44126-201ENSMUST00000204831 514 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Atp1b4Q99ME6 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atp1b4Q99ME6 AC159819.2-201ENSMUST00000216151 342 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Atp1b4Q99ME6 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atp1b4Q99ME6 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atp1b4Q99ME6 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atp1b4Q99ME6 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atp1b4Q99ME6 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atp1b4Q99ME6 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atp1b4Q99ME6 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atp1b4Q99ME6 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Atp1b4Q99ME6 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atp1b4Q99ME6 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atp1b4Q99ME6 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atp1b4Q99ME6 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atp1b4Q99ME6 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atp1b4Q99ME6 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atp1b4Q99ME6 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atp1b4Q99ME6 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atp1b4Q99ME6 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atp1b4Q99ME6 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atp1b4Q99ME6 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atp1b4Q99ME6 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atp1b4Q99ME6 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atp1b4Q99ME6 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atp1b4Q99ME6 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atp1b4Q99ME6 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atp1b4Q99ME6 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Atp1b4Q99ME6 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atp1b4Q99ME6 Ndufs5-203ENSMUST00000106207 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atp1b4Q99ME6 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atp1b4Q99ME6 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atp1b4Q99ME6 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Atp1b4Q99ME6 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Atp1b4Q99ME6 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atp1b4Q99ME6 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atp1b4Q99ME6 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atp1b4Q99ME6 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atp1b4Q99ME6 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atp1b4Q99ME6 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atp1b4Q99ME6 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atp1b4Q99ME6 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atp1b4Q99ME6 4833445I07Rik-202ENSMUST00000194104 579 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atp1b4Q99ME6 Gm38139-201ENSMUST00000195806 704 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atp1b4Q99ME6 Gm5051-201ENSMUST00000204085 485 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Atp1b4Q99ME6 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Atp1b4Q99ME6 D9Wsu149-201ENSMUST00000214169 594 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Atp1b4Q99ME6 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atp1b4Q99ME6 Ndufs5-201ENSMUST00000030401 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atp1b4Q99ME6 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atp1b4Q99ME6 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atp1b4Q99ME6 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atp1b4Q99ME6 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atp1b4Q99ME6 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atp1b4Q99ME6 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atp1b4Q99ME6 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atp1b4Q99ME6 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Atp1b4Q99ME6 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Atp1b4Q99ME6 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Atp1b4Q99ME6 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Atp1b4Q99ME6 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Atp1b4Q99ME6 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Atp1b4Q99ME6 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Atp1b4Q99ME6 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Atp1b4Q99ME6 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Atp1b4Q99ME6 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Atp1b4Q99ME6 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Atp1b4Q99ME6 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Atp1b4Q99ME6 Gm15131-201ENSMUST00000119124 595 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Atp1b4Q99ME6 Gm14665-201ENSMUST00000122294 557 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Atp1b4Q99ME6 Gm14291-201ENSMUST00000143645 804 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Atp1b4Q99ME6 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Atp1b4Q99ME6 Gm27438-201ENSMUST00000183480 110 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Atp1b4Q99ME6 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Atp1b4Q99ME6 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Atp1b4Q99ME6 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Atp1b4Q99ME6 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Atp1b4Q99ME6 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Atp1b4Q99ME6 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Atp1b4Q99ME6 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Atp1b4Q99ME6 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Atp1b4Q99ME6 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Atp1b4Q99ME6 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Atp1b4Q99ME6 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Atp1b4Q99ME6 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Atp1b4Q99ME6 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Atp1b4Q99ME6 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Atp1b4Q99ME6 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Atp1b4Q99ME6 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms