Protein–RNA interactions for Protein: Q99LY2

Gdpd3, Lysophospholipase D GDPD3, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdpd3Q99LY2 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gdpd3Q99LY2 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gdpd3Q99LY2 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gdpd3Q99LY2 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gdpd3Q99LY2 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Gdpd3Q99LY2 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Gdpd3Q99LY2 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gdpd3Q99LY2 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gdpd3Q99LY2 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Gdpd3Q99LY2 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gdpd3Q99LY2 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Gdpd3Q99LY2 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gdpd3Q99LY2 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gdpd3Q99LY2 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gdpd3Q99LY2 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gdpd3Q99LY2 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gdpd3Q99LY2 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gdpd3Q99LY2 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gdpd3Q99LY2 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gdpd3Q99LY2 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gdpd3Q99LY2 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gdpd3Q99LY2 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gdpd3Q99LY2 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gdpd3Q99LY2 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gdpd3Q99LY2 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gdpd3Q99LY2 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gdpd3Q99LY2 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gdpd3Q99LY2 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gdpd3Q99LY2 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gdpd3Q99LY2 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gdpd3Q99LY2 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gdpd3Q99LY2 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gdpd3Q99LY2 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gdpd3Q99LY2 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gdpd3Q99LY2 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gdpd3Q99LY2 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gdpd3Q99LY2 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gdpd3Q99LY2 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gdpd3Q99LY2 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Gdpd3Q99LY2 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gdpd3Q99LY2 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Gdpd3Q99LY2 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gdpd3Q99LY2 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gdpd3Q99LY2 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gdpd3Q99LY2 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Gdpd3Q99LY2 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Gdpd3Q99LY2 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Gdpd3Q99LY2 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gdpd3Q99LY2 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Gdpd3Q99LY2 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gdpd3Q99LY2 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gdpd3Q99LY2 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gdpd3Q99LY2 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Gdpd3Q99LY2 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gdpd3Q99LY2 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gdpd3Q99LY2 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gdpd3Q99LY2 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gdpd3Q99LY2 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gdpd3Q99LY2 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gdpd3Q99LY2 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gdpd3Q99LY2 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gdpd3Q99LY2 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gdpd3Q99LY2 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gdpd3Q99LY2 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gdpd3Q99LY2 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gdpd3Q99LY2 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gdpd3Q99LY2 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Gdpd3Q99LY2 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Gdpd3Q99LY2 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Gdpd3Q99LY2 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Gdpd3Q99LY2 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gdpd3Q99LY2 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gdpd3Q99LY2 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gdpd3Q99LY2 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gdpd3Q99LY2 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gdpd3Q99LY2 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gdpd3Q99LY2 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gdpd3Q99LY2 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gdpd3Q99LY2 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gdpd3Q99LY2 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gdpd3Q99LY2 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gdpd3Q99LY2 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gdpd3Q99LY2 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gdpd3Q99LY2 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gdpd3Q99LY2 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gdpd3Q99LY2 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gdpd3Q99LY2 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gdpd3Q99LY2 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gdpd3Q99LY2 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gdpd3Q99LY2 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gdpd3Q99LY2 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gdpd3Q99LY2 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gdpd3Q99LY2 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gdpd3Q99LY2 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Gdpd3Q99LY2 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Gdpd3Q99LY2 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gdpd3Q99LY2 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gdpd3Q99LY2 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gdpd3Q99LY2 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gdpd3Q99LY2 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.1 ms