Protein–RNA interactions for Protein: Q99KG7

Hps4, Hermansky-Pudlak syndrome 4 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 671 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps4Q99KG7 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hps4Q99KG7 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Hps4Q99KG7 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Hps4Q99KG7 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Hps4Q99KG7 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Hps4Q99KG7 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hps4Q99KG7 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hps4Q99KG7 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hps4Q99KG7 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hps4Q99KG7 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Hps4Q99KG7 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hps4Q99KG7 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hps4Q99KG7 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hps4Q99KG7 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hps4Q99KG7 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hps4Q99KG7 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hps4Q99KG7 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hps4Q99KG7 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hps4Q99KG7 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hps4Q99KG7 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hps4Q99KG7 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hps4Q99KG7 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hps4Q99KG7 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hps4Q99KG7 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hps4Q99KG7 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hps4Q99KG7 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hps4Q99KG7 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hps4Q99KG7 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hps4Q99KG7 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hps4Q99KG7 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hps4Q99KG7 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hps4Q99KG7 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Hps4Q99KG7 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hps4Q99KG7 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hps4Q99KG7 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Hps4Q99KG7 Gm43930-201ENSMUST00000203868 845 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Hps4Q99KG7 Gm45609-204ENSMUST00000209837 1207 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hps4Q99KG7 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hps4Q99KG7 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hps4Q99KG7 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hps4Q99KG7 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hps4Q99KG7 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hps4Q99KG7 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hps4Q99KG7 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hps4Q99KG7 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hps4Q99KG7 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hps4Q99KG7 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hps4Q99KG7 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Hps4Q99KG7 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hps4Q99KG7 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hps4Q99KG7 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Hps4Q99KG7 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hps4Q99KG7 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hps4Q99KG7 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hps4Q99KG7 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hps4Q99KG7 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hps4Q99KG7 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hps4Q99KG7 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hps4Q99KG7 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hps4Q99KG7 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hps4Q99KG7 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hps4Q99KG7 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hps4Q99KG7 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hps4Q99KG7 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hps4Q99KG7 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hps4Q99KG7 Gm13857-203ENSMUST00000150561 2337 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hps4Q99KG7 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hps4Q99KG7 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hps4Q99KG7 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hps4Q99KG7 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Hps4Q99KG7 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hps4Q99KG7 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hps4Q99KG7 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Hps4Q99KG7 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Hps4Q99KG7 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hps4Q99KG7 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Hps4Q99KG7 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Hps4Q99KG7 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hps4Q99KG7 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Hps4Q99KG7 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Hps4Q99KG7 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hps4Q99KG7 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hps4Q99KG7 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hps4Q99KG7 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hps4Q99KG7 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hps4Q99KG7 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hps4Q99KG7 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hps4Q99KG7 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hps4Q99KG7 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hps4Q99KG7 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hps4Q99KG7 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hps4Q99KG7 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hps4Q99KG7 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hps4Q99KG7 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hps4Q99KG7 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hps4Q99KG7 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hps4Q99KG7 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hps4Q99KG7 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hps4Q99KG7 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hps4Q99KG7 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms