Protein–RNA interactions for Protein: Q99KF1

Tmed9, Transmembrane emp24 domain-containing protein 9, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed9Q99KF1 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmed9Q99KF1 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmed9Q99KF1 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmed9Q99KF1 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmed9Q99KF1 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmed9Q99KF1 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmed9Q99KF1 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmed9Q99KF1 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmed9Q99KF1 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmed9Q99KF1 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmed9Q99KF1 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmed9Q99KF1 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmed9Q99KF1 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmed9Q99KF1 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmed9Q99KF1 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmed9Q99KF1 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmed9Q99KF1 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmed9Q99KF1 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmed9Q99KF1 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmed9Q99KF1 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmed9Q99KF1 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmed9Q99KF1 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmed9Q99KF1 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmed9Q99KF1 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmed9Q99KF1 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmed9Q99KF1 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmed9Q99KF1 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmed9Q99KF1 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmed9Q99KF1 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmed9Q99KF1 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmed9Q99KF1 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmed9Q99KF1 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmed9Q99KF1 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmed9Q99KF1 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmed9Q99KF1 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmed9Q99KF1 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmed9Q99KF1 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmed9Q99KF1 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmed9Q99KF1 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmed9Q99KF1 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmed9Q99KF1 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmed9Q99KF1 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmed9Q99KF1 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmed9Q99KF1 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmed9Q99KF1 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmed9Q99KF1 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmed9Q99KF1 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmed9Q99KF1 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmed9Q99KF1 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmed9Q99KF1 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmed9Q99KF1 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmed9Q99KF1 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmed9Q99KF1 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmed9Q99KF1 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmed9Q99KF1 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmed9Q99KF1 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmed9Q99KF1 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmed9Q99KF1 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmed9Q99KF1 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmed9Q99KF1 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmed9Q99KF1 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmed9Q99KF1 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmed9Q99KF1 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmed9Q99KF1 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmed9Q99KF1 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmed9Q99KF1 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmed9Q99KF1 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmed9Q99KF1 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmed9Q99KF1 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmed9Q99KF1 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmed9Q99KF1 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmed9Q99KF1 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmed9Q99KF1 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmed9Q99KF1 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmed9Q99KF1 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmed9Q99KF1 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmed9Q99KF1 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmed9Q99KF1 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmed9Q99KF1 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmed9Q99KF1 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmed9Q99KF1 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmed9Q99KF1 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmed9Q99KF1 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmed9Q99KF1 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmed9Q99KF1 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmed9Q99KF1 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmed9Q99KF1 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmed9Q99KF1 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmed9Q99KF1 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmed9Q99KF1 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmed9Q99KF1 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmed9Q99KF1 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmed9Q99KF1 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmed9Q99KF1 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmed9Q99KF1 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmed9Q99KF1 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmed9Q99KF1 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmed9Q99KF1 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmed9Q99KF1 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmed9Q99KF1 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms