Protein–RNA interactions for Protein: Q925H1

Trps1, Zinc finger transcription factor Trps1, mousemouse

Predictions only

Length 1,281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trps1Q925H1 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Trps1Q925H1 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trps1Q925H1 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Trps1Q925H1 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Trps1Q925H1 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trps1Q925H1 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trps1Q925H1 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trps1Q925H1 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trps1Q925H1 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trps1Q925H1 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trps1Q925H1 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trps1Q925H1 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trps1Q925H1 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trps1Q925H1 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trps1Q925H1 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trps1Q925H1 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trps1Q925H1 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trps1Q925H1 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trps1Q925H1 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trps1Q925H1 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trps1Q925H1 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trps1Q925H1 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trps1Q925H1 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trps1Q925H1 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trps1Q925H1 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trps1Q925H1 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trps1Q925H1 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trps1Q925H1 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trps1Q925H1 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trps1Q925H1 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Trps1Q925H1 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Trps1Q925H1 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trps1Q925H1 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Trps1Q925H1 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trps1Q925H1 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trps1Q925H1 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trps1Q925H1 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trps1Q925H1 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trps1Q925H1 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trps1Q925H1 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trps1Q925H1 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trps1Q925H1 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trps1Q925H1 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trps1Q925H1 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trps1Q925H1 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trps1Q925H1 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trps1Q925H1 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trps1Q925H1 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trps1Q925H1 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trps1Q925H1 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trps1Q925H1 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trps1Q925H1 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Trps1Q925H1 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trps1Q925H1 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trps1Q925H1 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trps1Q925H1 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trps1Q925H1 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trps1Q925H1 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trps1Q925H1 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Trps1Q925H1 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trps1Q925H1 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trps1Q925H1 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trps1Q925H1 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trps1Q925H1 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trps1Q925H1 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trps1Q925H1 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trps1Q925H1 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trps1Q925H1 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trps1Q925H1 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trps1Q925H1 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trps1Q925H1 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Trps1Q925H1 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Trps1Q925H1 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trps1Q925H1 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trps1Q925H1 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trps1Q925H1 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trps1Q925H1 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trps1Q925H1 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trps1Q925H1 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trps1Q925H1 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trps1Q925H1 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trps1Q925H1 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trps1Q925H1 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trps1Q925H1 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trps1Q925H1 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trps1Q925H1 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trps1Q925H1 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trps1Q925H1 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trps1Q925H1 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trps1Q925H1 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trps1Q925H1 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trps1Q925H1 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trps1Q925H1 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trps1Q925H1 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trps1Q925H1 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trps1Q925H1 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trps1Q925H1 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trps1Q925H1 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trps1Q925H1 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trps1Q925H1 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms