Protein–RNA interactions for Protein: Q923L3

Csmd1, CUB and sushi domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 3,564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csmd1Q923L3 Gm10334-201ENSMUST00000095999 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Csmd1Q923L3 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Csmd1Q923L3 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Csmd1Q923L3 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Csmd1Q923L3 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Csmd1Q923L3 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Csmd1Q923L3 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Csmd1Q923L3 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Csmd1Q923L3 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Csmd1Q923L3 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Csmd1Q923L3 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Csmd1Q923L3 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Csmd1Q923L3 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Csmd1Q923L3 Nudt7-204ENSMUST00000134593 707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Csmd1Q923L3 Gm23675-201ENSMUST00000157311 125 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Csmd1Q923L3 Gm24844-201ENSMUST00000158679 127 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Csmd1Q923L3 Gm9507-202ENSMUST00000180157 654 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Csmd1Q923L3 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Csmd1Q923L3 Gm4604-201ENSMUST00000025040 390 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Csmd1Q923L3 Etv1-205ENSMUST00000160856 1474 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Csmd1Q923L3 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Csmd1Q923L3 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Csmd1Q923L3 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Csmd1Q923L3 Cpsf4l-202ENSMUST00000100248 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Csmd1Q923L3 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Csmd1Q923L3 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Csmd1Q923L3 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Csmd1Q923L3 Gm25063-201ENSMUST00000104666 94 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Csmd1Q923L3 Ntm-202ENSMUST00000115236 1072 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Csmd1Q923L3 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Csmd1Q923L3 Gm11205-201ENSMUST00000137738 431 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Csmd1Q923L3 Gm20536-201ENSMUST00000172588 406 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Csmd1Q923L3 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Csmd1Q923L3 D5Ertd615e-203ENSMUST00000198493 1032 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Csmd1Q923L3 AC115122.1-201ENSMUST00000224850 1040 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Csmd1Q923L3 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Csmd1Q923L3 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Csmd1Q923L3 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Csmd1Q923L3 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Csmd1Q923L3 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Csmd1Q923L3 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Csmd1Q923L3 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Csmd1Q923L3 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Csmd1Q923L3 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Csmd1Q923L3 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Csmd1Q923L3 Mfsd11-212ENSMUST00000153084 1194 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Csmd1Q923L3 Ppy-201ENSMUST00000017460 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Csmd1Q923L3 Mir6973a-201ENSMUST00000183646 78 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Csmd1Q923L3 Gm42433-201ENSMUST00000196806 940 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Csmd1Q923L3 Gm43001-201ENSMUST00000198925 603 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Csmd1Q923L3 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Csmd1Q923L3 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Csmd1Q923L3 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Csmd1Q923L3 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Csmd1Q923L3 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Csmd1Q923L3 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Csmd1Q923L3 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Csmd1Q923L3 Rnf133-202ENSMUST00000115354 1333 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Csmd1Q923L3 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Csmd1Q923L3 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Csmd1Q923L3 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Csmd1Q923L3 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Csmd1Q923L3 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Csmd1Q923L3 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Csmd1Q923L3 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Csmd1Q923L3 Gm11949-201ENSMUST00000117640 372 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Csmd1Q923L3 Tbata-203ENSMUST00000121297 1000 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Csmd1Q923L3 Wdr53-204ENSMUST00000178573 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Csmd1Q923L3 Gm7719-201ENSMUST00000182374 975 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Csmd1Q923L3 Chn2-212ENSMUST00000204115 783 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Csmd1Q923L3 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Csmd1Q923L3 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Csmd1Q923L3 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Csmd1Q923L3 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Csmd1Q923L3 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Csmd1Q923L3 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Csmd1Q923L3 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Csmd1Q923L3 Opn1mw-202ENSMUST00000101457 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Csmd1Q923L3 Gm12246-201ENSMUST00000129126 503 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Csmd1Q923L3 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Csmd1Q923L3 Gm21844-201ENSMUST00000178699 663 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Csmd1Q923L3 Gm31166-202ENSMUST00000210638 1268 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Csmd1Q923L3 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Csmd1Q923L3 Retnla-201ENSMUST00000023329 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Csmd1Q923L3 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Csmd1Q923L3 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Csmd1Q923L3 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Csmd1Q923L3 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Csmd1Q923L3 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Csmd1Q923L3 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Csmd1Q923L3 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Csmd1Q923L3 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Csmd1Q923L3 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Csmd1Q923L3 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Csmd1Q923L3 Gm25076-201ENSMUST00000104098 132 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Csmd1Q923L3 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Csmd1Q923L3 Gm14718-201ENSMUST00000138082 752 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Csmd1Q923L3 AC158605.1-201ENSMUST00000156803 764 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Csmd1Q923L3 Olfr431-ps1-201ENSMUST00000192435 544 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Csmd1Q923L3 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
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