Protein–RNA interactions for Protein: Q920F6

Smc1b, Structural maintenance of chromosomes protein 1B, mousemouse

Predictions only

Length 1,248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smc1bQ920F6 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smc1bQ920F6 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smc1bQ920F6 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smc1bQ920F6 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smc1bQ920F6 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Smc1bQ920F6 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smc1bQ920F6 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smc1bQ920F6 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smc1bQ920F6 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smc1bQ920F6 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Smc1bQ920F6 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smc1bQ920F6 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smc1bQ920F6 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smc1bQ920F6 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smc1bQ920F6 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smc1bQ920F6 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smc1bQ920F6 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smc1bQ920F6 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smc1bQ920F6 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smc1bQ920F6 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smc1bQ920F6 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smc1bQ920F6 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smc1bQ920F6 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smc1bQ920F6 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smc1bQ920F6 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smc1bQ920F6 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smc1bQ920F6 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smc1bQ920F6 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Smc1bQ920F6 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smc1bQ920F6 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smc1bQ920F6 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smc1bQ920F6 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smc1bQ920F6 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smc1bQ920F6 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smc1bQ920F6 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smc1bQ920F6 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smc1bQ920F6 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smc1bQ920F6 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Smc1bQ920F6 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Smc1bQ920F6 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smc1bQ920F6 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smc1bQ920F6 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smc1bQ920F6 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smc1bQ920F6 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smc1bQ920F6 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smc1bQ920F6 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smc1bQ920F6 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smc1bQ920F6 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smc1bQ920F6 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smc1bQ920F6 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smc1bQ920F6 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smc1bQ920F6 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smc1bQ920F6 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smc1bQ920F6 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smc1bQ920F6 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smc1bQ920F6 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smc1bQ920F6 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smc1bQ920F6 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smc1bQ920F6 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smc1bQ920F6 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smc1bQ920F6 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smc1bQ920F6 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Smc1bQ920F6 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smc1bQ920F6 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smc1bQ920F6 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smc1bQ920F6 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smc1bQ920F6 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smc1bQ920F6 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smc1bQ920F6 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smc1bQ920F6 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smc1bQ920F6 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smc1bQ920F6 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Smc1bQ920F6 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Smc1bQ920F6 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smc1bQ920F6 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Smc1bQ920F6 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Smc1bQ920F6 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smc1bQ920F6 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smc1bQ920F6 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Smc1bQ920F6 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smc1bQ920F6 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smc1bQ920F6 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smc1bQ920F6 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smc1bQ920F6 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smc1bQ920F6 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smc1bQ920F6 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smc1bQ920F6 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smc1bQ920F6 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smc1bQ920F6 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smc1bQ920F6 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smc1bQ920F6 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smc1bQ920F6 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smc1bQ920F6 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smc1bQ920F6 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smc1bQ920F6 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Smc1bQ920F6 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smc1bQ920F6 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smc1bQ920F6 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smc1bQ920F6 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Smc1bQ920F6 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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