Protein–RNA interactions for Protein: Q91W36

Usp3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp3Q91W36 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp3Q91W36 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp3Q91W36 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp3Q91W36 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Usp3Q91W36 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp3Q91W36 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp3Q91W36 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp3Q91W36 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp3Q91W36 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp3Q91W36 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp3Q91W36 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp3Q91W36 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp3Q91W36 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp3Q91W36 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp3Q91W36 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp3Q91W36 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp3Q91W36 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp3Q91W36 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp3Q91W36 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp3Q91W36 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp3Q91W36 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp3Q91W36 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp3Q91W36 Gm16420-201ENSMUST00000120258 856 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp3Q91W36 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp3Q91W36 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp3Q91W36 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp3Q91W36 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp3Q91W36 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp3Q91W36 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp3Q91W36 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp3Q91W36 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp3Q91W36 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp3Q91W36 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp3Q91W36 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp3Q91W36 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp3Q91W36 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp3Q91W36 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp3Q91W36 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp3Q91W36 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Usp3Q91W36 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp3Q91W36 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp3Q91W36 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp3Q91W36 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp3Q91W36 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp3Q91W36 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp3Q91W36 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp3Q91W36 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp3Q91W36 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp3Q91W36 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp3Q91W36 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp3Q91W36 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Usp3Q91W36 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp3Q91W36 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Usp3Q91W36 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp3Q91W36 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp3Q91W36 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Usp3Q91W36 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Usp3Q91W36 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Usp3Q91W36 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Usp3Q91W36 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Usp3Q91W36 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp3Q91W36 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
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Usp3Q91W36 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp3Q91W36 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp3Q91W36 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Usp3Q91W36 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp3Q91W36 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp3Q91W36 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp3Q91W36 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp3Q91W36 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp3Q91W36 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp3Q91W36 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp3Q91W36 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp3Q91W36 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp3Q91W36 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp3Q91W36 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp3Q91W36 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp3Q91W36 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp3Q91W36 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp3Q91W36 Gm37965-201ENSMUST00000195304 1362 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp3Q91W36 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp3Q91W36 Asb11-201ENSMUST00000033755 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp3Q91W36 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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