Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE18

Smg8, Protein SMG8, mousemouse

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Length 991 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg8Q8VE18 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smg8Q8VE18 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smg8Q8VE18 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smg8Q8VE18 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smg8Q8VE18 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smg8Q8VE18 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smg8Q8VE18 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smg8Q8VE18 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Smg8Q8VE18 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smg8Q8VE18 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smg8Q8VE18 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smg8Q8VE18 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smg8Q8VE18 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smg8Q8VE18 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Smg8Q8VE18 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smg8Q8VE18 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Smg8Q8VE18 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smg8Q8VE18 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Smg8Q8VE18 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Smg8Q8VE18 Gm19891-201ENSMUST00000189771 303 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Smg8Q8VE18 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Smg8Q8VE18 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Smg8Q8VE18 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Smg8Q8VE18 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Smg8Q8VE18 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Smg8Q8VE18 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smg8Q8VE18 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smg8Q8VE18 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smg8Q8VE18 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smg8Q8VE18 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smg8Q8VE18 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Smg8Q8VE18 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smg8Q8VE18 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Smg8Q8VE18 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smg8Q8VE18 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smg8Q8VE18 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Smg8Q8VE18 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smg8Q8VE18 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smg8Q8VE18 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smg8Q8VE18 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Smg8Q8VE18 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Smg8Q8VE18 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Smg8Q8VE18 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Smg8Q8VE18 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Smg8Q8VE18 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Smg8Q8VE18 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Smg8Q8VE18 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Smg8Q8VE18 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Smg8Q8VE18 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Smg8Q8VE18 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Smg8Q8VE18 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Smg8Q8VE18 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Smg8Q8VE18 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Smg8Q8VE18 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Smg8Q8VE18 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Smg8Q8VE18 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Smg8Q8VE18 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Smg8Q8VE18 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Smg8Q8VE18 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Smg8Q8VE18 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Smg8Q8VE18 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Smg8Q8VE18 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Smg8Q8VE18 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Smg8Q8VE18 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Smg8Q8VE18 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Smg8Q8VE18 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Smg8Q8VE18 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Smg8Q8VE18 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Smg8Q8VE18 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Smg8Q8VE18 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Smg8Q8VE18 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Smg8Q8VE18 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Smg8Q8VE18 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Smg8Q8VE18 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Smg8Q8VE18 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Smg8Q8VE18 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Smg8Q8VE18 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Smg8Q8VE18 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Smg8Q8VE18 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smg8Q8VE18 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smg8Q8VE18 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smg8Q8VE18 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smg8Q8VE18 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smg8Q8VE18 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smg8Q8VE18 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smg8Q8VE18 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smg8Q8VE18 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smg8Q8VE18 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smg8Q8VE18 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Smg8Q8VE18 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smg8Q8VE18 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smg8Q8VE18 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smg8Q8VE18 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smg8Q8VE18 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smg8Q8VE18 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Smg8Q8VE18 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smg8Q8VE18 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smg8Q8VE18 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smg8Q8VE18 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smg8Q8VE18 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
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