Protein–RNA interactions for Protein: Q8VD57

Sft2d2, Vesicle transport protein SFT2B, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d2Q8VD57 Megf11-201ENSMUST00000068967 6680 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sft2d2Q8VD57 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sft2d2Q8VD57 Grin1-208ENSMUST00000114318 3920 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sft2d2Q8VD57 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sft2d2Q8VD57 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sft2d2Q8VD57 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sft2d2Q8VD57 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sft2d2Q8VD57 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sft2d2Q8VD57 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sft2d2Q8VD57 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sft2d2Q8VD57 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sft2d2Q8VD57 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sft2d2Q8VD57 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sft2d2Q8VD57 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sft2d2Q8VD57 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sft2d2Q8VD57 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sft2d2Q8VD57 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sft2d2Q8VD57 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sft2d2Q8VD57 Tnfaip3-201ENSMUST00000019997 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sft2d2Q8VD57 Ntng1-211ENSMUST00000156177 4652 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sft2d2Q8VD57 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sft2d2Q8VD57 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sft2d2Q8VD57 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sft2d2Q8VD57 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sft2d2Q8VD57 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sft2d2Q8VD57 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sft2d2Q8VD57 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sft2d2Q8VD57 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sft2d2Q8VD57 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sft2d2Q8VD57 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sft2d2Q8VD57 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sft2d2Q8VD57 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sft2d2Q8VD57 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sft2d2Q8VD57 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sft2d2Q8VD57 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sft2d2Q8VD57 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Sft2d2Q8VD57 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sft2d2Q8VD57 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sft2d2Q8VD57 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sft2d2Q8VD57 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sft2d2Q8VD57 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sft2d2Q8VD57 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Sft2d2Q8VD57 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sft2d2Q8VD57 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sft2d2Q8VD57 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Sft2d2Q8VD57 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sft2d2Q8VD57 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sft2d2Q8VD57 Scn10a-201ENSMUST00000084787 6416 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sft2d2Q8VD57 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sft2d2Q8VD57 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sft2d2Q8VD57 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Sft2d2Q8VD57 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Sft2d2Q8VD57 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Sft2d2Q8VD57 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Sft2d2Q8VD57 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
Sft2d2Q8VD57 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Sft2d2Q8VD57 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Sft2d2Q8VD57 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Sft2d2Q8VD57 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sft2d2Q8VD57 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sft2d2Q8VD57 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sft2d2Q8VD57 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sft2d2Q8VD57 Ece1-201ENSMUST00000102518 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sft2d2Q8VD57 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sft2d2Q8VD57 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sft2d2Q8VD57 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sft2d2Q8VD57 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sft2d2Q8VD57 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sft2d2Q8VD57 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sft2d2Q8VD57 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sft2d2Q8VD57 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sft2d2Q8VD57 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sft2d2Q8VD57 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sft2d2Q8VD57 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sft2d2Q8VD57 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sft2d2Q8VD57 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sft2d2Q8VD57 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sft2d2Q8VD57 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sft2d2Q8VD57 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sft2d2Q8VD57 C2cd5-203ENSMUST00000171349 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sft2d2Q8VD57 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sft2d2Q8VD57 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sft2d2Q8VD57 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sft2d2Q8VD57 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sft2d2Q8VD57 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sft2d2Q8VD57 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sft2d2Q8VD57 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sft2d2Q8VD57 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Sft2d2Q8VD57 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sft2d2Q8VD57 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sft2d2Q8VD57 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sft2d2Q8VD57 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sft2d2Q8VD57 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sft2d2Q8VD57 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sft2d2Q8VD57 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sft2d2Q8VD57 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sft2d2Q8VD57 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sft2d2Q8VD57 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sft2d2Q8VD57 Tyk2-203ENSMUST00000214454 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sft2d2Q8VD57 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
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