Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH7

Rdh10, Retinol dehydrogenase 10, mousemouse

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Length 341 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh10Q8VCH7 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
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Rdh10Q8VCH7 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rdh10Q8VCH7 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rdh10Q8VCH7 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rdh10Q8VCH7 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rdh10Q8VCH7 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Rdh10Q8VCH7 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rdh10Q8VCH7 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Rdh10Q8VCH7 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rdh10Q8VCH7 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Rdh10Q8VCH7 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rdh10Q8VCH7 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rdh10Q8VCH7 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rdh10Q8VCH7 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Rdh10Q8VCH7 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rdh10Q8VCH7 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rdh10Q8VCH7 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rdh10Q8VCH7 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rdh10Q8VCH7 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rdh10Q8VCH7 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rdh10Q8VCH7 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rdh10Q8VCH7 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rdh10Q8VCH7 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rdh10Q8VCH7 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rdh10Q8VCH7 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
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Rdh10Q8VCH7 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rdh10Q8VCH7 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rdh10Q8VCH7 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
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Rdh10Q8VCH7 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rdh10Q8VCH7 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rdh10Q8VCH7 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rdh10Q8VCH7 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rdh10Q8VCH7 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rdh10Q8VCH7 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
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Rdh10Q8VCH7 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Rdh10Q8VCH7 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
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Rdh10Q8VCH7 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rdh10Q8VCH7 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rdh10Q8VCH7 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rdh10Q8VCH7 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rdh10Q8VCH7 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rdh10Q8VCH7 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rdh10Q8VCH7 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rdh10Q8VCH7 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
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Rdh10Q8VCH7 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rdh10Q8VCH7 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
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Rdh10Q8VCH7 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rdh10Q8VCH7 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rdh10Q8VCH7 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rdh10Q8VCH7 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
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Rdh10Q8VCH7 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
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Rdh10Q8VCH7 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rdh10Q8VCH7 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
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Rdh10Q8VCH7 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rdh10Q8VCH7 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rdh10Q8VCH7 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rdh10Q8VCH7 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
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Rdh10Q8VCH7 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rdh10Q8VCH7 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rdh10Q8VCH7 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rdh10Q8VCH7 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rdh10Q8VCH7 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rdh10Q8VCH7 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rdh10Q8VCH7 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rdh10Q8VCH7 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rdh10Q8VCH7 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rdh10Q8VCH7 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rdh10Q8VCH7 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Rdh10Q8VCH7 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rdh10Q8VCH7 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Rdh10Q8VCH7 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
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Rdh10Q8VCH7 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rdh10Q8VCH7 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rdh10Q8VCH7 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rdh10Q8VCH7 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
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