Protein–RNA interactions for Protein: Q8R332

Nup58, Nucleoporin p58/p45, mousemouse

Predictions only

Length 587 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup58Q8R332 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nup58Q8R332 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nup58Q8R332 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nup58Q8R332 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nup58Q8R332 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nup58Q8R332 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nup58Q8R332 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nup58Q8R332 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nup58Q8R332 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nup58Q8R332 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Nup58Q8R332 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nup58Q8R332 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nup58Q8R332 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nup58Q8R332 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nup58Q8R332 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nup58Q8R332 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nup58Q8R332 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nup58Q8R332 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nup58Q8R332 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nup58Q8R332 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Nup58Q8R332 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Nup58Q8R332 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nup58Q8R332 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nup58Q8R332 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nup58Q8R332 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nup58Q8R332 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nup58Q8R332 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nup58Q8R332 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Nup58Q8R332 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Nup58Q8R332 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nup58Q8R332 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nup58Q8R332 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nup58Q8R332 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nup58Q8R332 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nup58Q8R332 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nup58Q8R332 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Nup58Q8R332 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nup58Q8R332 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nup58Q8R332 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nup58Q8R332 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Nup58Q8R332 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nup58Q8R332 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nup58Q8R332 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nup58Q8R332 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nup58Q8R332 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nup58Q8R332 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nup58Q8R332 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nup58Q8R332 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nup58Q8R332 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nup58Q8R332 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nup58Q8R332 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nup58Q8R332 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nup58Q8R332 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nup58Q8R332 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Nup58Q8R332 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nup58Q8R332 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nup58Q8R332 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Nup58Q8R332 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Nup58Q8R332 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Nup58Q8R332 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Nup58Q8R332 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Nup58Q8R332 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nup58Q8R332 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nup58Q8R332 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nup58Q8R332 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nup58Q8R332 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nup58Q8R332 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nup58Q8R332 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nup58Q8R332 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nup58Q8R332 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nup58Q8R332 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nup58Q8R332 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nup58Q8R332 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nup58Q8R332 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nup58Q8R332 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nup58Q8R332 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nup58Q8R332 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nup58Q8R332 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nup58Q8R332 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nup58Q8R332 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nup58Q8R332 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Nup58Q8R332 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nup58Q8R332 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nup58Q8R332 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nup58Q8R332 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nup58Q8R332 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Nup58Q8R332 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Nup58Q8R332 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nup58Q8R332 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nup58Q8R332 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Nup58Q8R332 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Nup58Q8R332 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nup58Q8R332 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nup58Q8R332 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nup58Q8R332 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nup58Q8R332 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nup58Q8R332 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nup58Q8R332 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nup58Q8R332 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nup58Q8R332 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
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