Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Z2

Prpf39, Pre-mRNA-processing factor 39, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf39Q8K2Z2 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Prpf39Q8K2Z2 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Prpf39Q8K2Z2 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prpf39Q8K2Z2 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prpf39Q8K2Z2 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Prpf39Q8K2Z2 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Prpf39Q8K2Z2 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prpf39Q8K2Z2 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prpf39Q8K2Z2 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Prpf39Q8K2Z2 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prpf39Q8K2Z2 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prpf39Q8K2Z2 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prpf39Q8K2Z2 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Prpf39Q8K2Z2 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prpf39Q8K2Z2 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prpf39Q8K2Z2 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prpf39Q8K2Z2 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Prpf39Q8K2Z2 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prpf39Q8K2Z2 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Prpf39Q8K2Z2 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prpf39Q8K2Z2 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prpf39Q8K2Z2 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Prpf39Q8K2Z2 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Prpf39Q8K2Z2 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Prpf39Q8K2Z2 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Prpf39Q8K2Z2 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Prpf39Q8K2Z2 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Prpf39Q8K2Z2 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Prpf39Q8K2Z2 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Prpf39Q8K2Z2 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Prpf39Q8K2Z2 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Prpf39Q8K2Z2 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Prpf39Q8K2Z2 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Prpf39Q8K2Z2 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Prpf39Q8K2Z2 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Prpf39Q8K2Z2 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Prpf39Q8K2Z2 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Prpf39Q8K2Z2 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Prpf39Q8K2Z2 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Prpf39Q8K2Z2 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Prpf39Q8K2Z2 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Prpf39Q8K2Z2 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Prpf39Q8K2Z2 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Prpf39Q8K2Z2 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Prpf39Q8K2Z2 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Prpf39Q8K2Z2 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Prpf39Q8K2Z2 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Prpf39Q8K2Z2 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Prpf39Q8K2Z2 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Prpf39Q8K2Z2 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Prpf39Q8K2Z2 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Prpf39Q8K2Z2 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Prpf39Q8K2Z2 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Prpf39Q8K2Z2 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Prpf39Q8K2Z2 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Prpf39Q8K2Z2 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Prpf39Q8K2Z2 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Prpf39Q8K2Z2 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Prpf39Q8K2Z2 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Prpf39Q8K2Z2 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Prpf39Q8K2Z2 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Prpf39Q8K2Z2 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Prpf39Q8K2Z2 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Prpf39Q8K2Z2 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Prpf39Q8K2Z2 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Prpf39Q8K2Z2 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Prpf39Q8K2Z2 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Prpf39Q8K2Z2 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Prpf39Q8K2Z2 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Prpf39Q8K2Z2 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Prpf39Q8K2Z2 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Prpf39Q8K2Z2 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Prpf39Q8K2Z2 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Prpf39Q8K2Z2 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Prpf39Q8K2Z2 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Prpf39Q8K2Z2 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Prpf39Q8K2Z2 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Prpf39Q8K2Z2 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Prpf39Q8K2Z2 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Prpf39Q8K2Z2 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Prpf39Q8K2Z2 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Prpf39Q8K2Z2 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Prpf39Q8K2Z2 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Prpf39Q8K2Z2 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Prpf39Q8K2Z2 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Prpf39Q8K2Z2 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Prpf39Q8K2Z2 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Prpf39Q8K2Z2 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Prpf39Q8K2Z2 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Prpf39Q8K2Z2 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Prpf39Q8K2Z2 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Prpf39Q8K2Z2 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Prpf39Q8K2Z2 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Prpf39Q8K2Z2 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Prpf39Q8K2Z2 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Prpf39Q8K2Z2 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Prpf39Q8K2Z2 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Prpf39Q8K2Z2 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Prpf39Q8K2Z2 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Prpf39Q8K2Z2 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms